?胚系突變(Germline Mutation)是指在人的胚胎發(fā)育期已經(jīng)攜帶的變異(幾乎全部遺傳自父母)今布,存在于生殖細(xì)胞內(nèi)具有遺傳性经备,構(gòu)成人與人的遺傳多樣性。 人體的所有細(xì)胞均應(yīng)帶有一致的胚系突變部默;但并非所有胚系突變具有致病性侵蒙。?
特點(diǎn): 先天性,遺傳
體細(xì)胞突變(Somatic Mutation)是指人體某些組織或者器官后天性地發(fā)生了體細(xì)胞變異傅蹂,雖然它不會(huì)遺傳給后代個(gè)體纷闺,卻可以通過(guò)細(xì)胞分裂,遺傳給子代細(xì)胞份蝴。 體細(xì)胞突變對(duì)腫瘤的發(fā)生發(fā)展有關(guān)鍵性的作用 犁功,并且它也是制定腫瘤癌癥靶向治療措施的關(guān)鍵所在。?
特點(diǎn):后天性婚夫,不遺傳
腫瘤突變負(fù)荷(tumor mutation burden浸卦,TMB ): 癌癥樣本全基因組中除去胚系DNA變異后每百萬(wàn)堿基體細(xì)胞突變數(shù)目。用來(lái)反映腫瘤細(xì)胞中總的基因突變程度的一個(gè)指標(biāo)案糙。TMB水平高的腫瘤限嫌,代表其腫瘤細(xì)胞中基因突變水平高靴庆,也反映細(xì)胞中可以被免疫系統(tǒng)識(shí)別的腫瘤新抗原可能更多。 可以依據(jù)次預(yù)測(cè)IO 免疫治療的效果怒医。
TMB 與PD-L1關(guān)系:TMB高的炉抒,PD-L1不一定低≈商荆可以考慮同時(shí)檢測(cè)兩者
微衛(wèi)星(microsatellite焰薄,MS)又稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeats,STR)扒袖,是基因組中以少數(shù)幾個(gè)核苷酸(2-4個(gè))為單位多次串聯(lián)重復(fù)組成的較長(zhǎng)(幾十個(gè))的核苷酸序列塞茅。最常見(jiàn)的有:雙核苷酸重復(fù),{(AC)/(TG)}n等僚稿。
分布:廣泛分布于真核生物基因組中凡桥。
特點(diǎn):PCR擴(kuò)增蟀伸,突變率高蚀同,共顯性遺傳,多態(tài)性啊掏。
根據(jù)重復(fù)結(jié)構(gòu)不同分類
完全重復(fù)型(perfect):?jiǎn)我恍蛄袉卧獰o(wú)中斷或顛倒蠢络。
不完全重復(fù)型(imperfect):?jiǎn)我恍蛄袉卧兄袛嗷蛘哳嵉埂?/p>
混合型(compound):介于兩者之間。微衛(wèi)星DNA重復(fù)序列兩側(cè)都有物種特異性的保守序列迟蜜。
微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(Microsatellite Instability刹孔,MSI )是指 DNA復(fù)制過(guò)程中,錯(cuò)配修復(fù)機(jī)制(DNA mismatch repair 娜睛,MMR)失靈髓霞,導(dǎo)致重復(fù)片段增加或者減少以致無(wú)法被機(jī)體修復(fù),引起微衛(wèi)星體長(zhǎng)度變化的現(xiàn)象畦戒。
正常機(jī)體可以識(shí)別檢測(cè)錯(cuò)配合成的DNA方库,而腫瘤組織因突變等因素引起DNA修復(fù)蛋白出錯(cuò),無(wú)法修復(fù)障斋。
根據(jù)MSI出現(xiàn)頻次分類
1. 微衛(wèi)星穩(wěn)定性(microsatellite stability纵潦,MSS ):微衛(wèi)星不發(fā)生突變。
2. 低頻微衛(wèi)星不穩(wěn)定性( low-frequency MSI垃环,MSI-L):患者微衛(wèi)星突變發(fā)現(xiàn)率低邀层。<40%
3. 高頻微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(High-frequency MSI,MSI-H):與上述相反遂庄。>40%
臨床價(jià)值:腫瘤預(yù)后預(yù)測(cè)寥院,免疫治療效果預(yù)測(cè)。
錯(cuò)配修復(fù)(mismatch repair涛目,MMR )秸谢,是在含有錯(cuò)配堿基的DNA分子中经磅,使核苷酸序列恢復(fù)正常的修復(fù)方式。當(dāng)MMR基因發(fā)生胚系突變或者發(fā)生甲基化將引起MMR功能降低钮追,導(dǎo)致DNA序列堿基錯(cuò)配预厌、缺失或插入不能得到修復(fù)。
MMR過(guò)程涉及到的MMR protein:MutS(MSH2元媚、3轧叽、6等)以及MutL(MLH1、3刊棕、PMS1炭晒、2),MMR主導(dǎo)蛋白:MLH1甥角、2网严、6、PMS2嗤无。其中MLH1蛋白編碼基因啟動(dòng)子區(qū)域收到甲基化調(diào)控震束,發(fā)生甲基化時(shí)會(huì)引起蛋白缺失。
根據(jù)MMR主導(dǎo)蛋白表達(dá)情況劃分為:錯(cuò)配修復(fù)基因缺陷(dMMR):4種蛋白有一種或以上表達(dá)缺失当犯;錯(cuò)配修復(fù)基因完整(pMMR):四種蛋白均表達(dá)
MMR與MSI-H的關(guān)系
1. dMMR垢村,MSS。發(fā)生dMMR時(shí)嚎卫,MSI可以為穩(wěn)定態(tài)嘉栓,原因:有的突變無(wú)傷大雅,不影響主要功能蛋白拓诸。
2. dMMR侵佃,MSI-H。但是當(dāng)主要蛋白編碼基因發(fā)生變異時(shí)奠支,錯(cuò)配修復(fù)功能受損馋辈,導(dǎo)致錯(cuò)誤的MSI修復(fù)失敗,發(fā)生MSI-H胚宦。
MMR與TMB的關(guān)系
當(dāng)腫瘤細(xì)胞中存在MMR基因功能缺失時(shí)(dMMR)首有,標(biāo)志著腫瘤細(xì)胞失去對(duì)DNA復(fù)制錯(cuò)誤的修復(fù)能力,這時(shí)腫瘤細(xì)胞內(nèi)將積累大量突變-->突變?cè)絹?lái)越多枢劝,腫瘤突變負(fù)荷(TMB)增加井联,進(jìn)而產(chǎn)生了相關(guān)新抗原-->淋巴細(xì)胞受到調(diào)動(dòng),抑制腫瘤生長(zhǎng)您旁,形成腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞烙常,免疫治療效果就越好。
參考:胚系突變
你真的理解體細(xì)胞突變嗎? - 云+社區(qū) - 騰訊云
腫瘤突變負(fù)荷(TMB):從希望到質(zhì)疑蚕脏,值得深思_患者
微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記及其應(yīng)用 - 分析行業(yè)新聞
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錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)(MMR)蛋白與微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)檢測(cè)結(jié)果小科普 - 知乎