賀建奎副教授的基因編輯技術(shù)或已成功——露露和娜娜CCR5氨基酸序列解析

LULU和NANA的CCR5基因圖譜和氨基酸序列已經(jīng)流傳出來拄衰,大家暢所欲言它褪,討論得很熱烈。我想做一個小結(jié)翘悉,敬請斧正茫打,說得不對的地方,還望方家海涵妖混。

先要說明老赤,基因測序和氨基酸序列圖譜中,CCR5Δ32沒有注明是誰的制市。根據(jù)邏輯推理抬旺,我默認是LULU的。從氨基酸序列圖來看祥楣,有五個序列开财,從上到下依次為野生型、LULU误褪、CCR5Δ32责鳍、NANA、NANA振坚。推測CCR5Δ32屬于LULU薇搁。因為一個人有兩個等位基因斋扰,NANA的兩個已經(jīng)明確渡八,LULU的一個已經(jīng)明確,因此CCR5Δ32可以默認為LULU的传货,對吧屎鳍?圖右下角有圖例,涂藍的是跨膜问裕,折線為二硫鍵逮壁,涂紅為LULU和NANA的氨基酸序列與野生型不同之處,可是只有三處粮宛。涂黑是CCR5Δ32和NANA的氨基酸序列與野生型不同之處窥淆,可是圖中并沒有任何地方涂黑,我估計是忘記涂黑了巍杈。應(yīng)該把CCR5Δ32涂黑忧饭。可是NANA的不同之處就三個了筷畦,不合邏輯词裤,因此CCR5Δ32理應(yīng)屬于LULU刺洒。

第一,兩個嬰兒的基因型:

①LULU

LULU 的兩個等位基因吼砂,一個切除了32個堿基對逆航,位置見圖1。另一個切除15個堿基對渔肩,位置見圖1因俐。圖中文字是我添加的。


圖1

這樣周偎,LULU 的基因型可以記作CCR5Δ32/Δ15女揭;

②NANA

NANA的兩個等位基因,一個切除了4個堿基對栏饮,位置見圖1吧兔。另一個插入一個堿基對,位置見圖1袍嬉、圖2境蔼。


圖2

這樣,NANA的基因型可以記作CCR5Δ4/+1伺通。

第二箍土,兩個嬰兒的氨基酸序列:

圖3是CCR5野生型跨膜蛋白和兩個嬰兒的CCR5跨膜蛋白的氨基酸序列。


圖3

第一小行:野生型罐监;

野生型CCR5蛋白質(zhì)是一個由352個氨基酸殘基組成的7次跨膜蛋白吴藻,其相對分子質(zhì)量約為38700道爾頓。

第二小行:LULU(默認) CCR5Δ15的氨基酸序列

CCG5Δ15是在第180個密碼子之后刪除了15個堿基沟堡。

由于每一個遺傳密碼子都是三個核苷酸組成(三聯(lián)堿基),刪除15個核苷酸航罗,恰好是3的整數(shù)倍屁药,因此粥血,CCR5Δ15后面的核苷酸序列保持不變酿箭,其表達的氨基酸序列也不變。因此缔御,這個序列的蛋白質(zhì)比野生型只少5個氨基酸殘基,其相對分子質(zhì)量約為38200道爾頓刹淌。

第三小行:LULU CCR5Δ32的氨基酸序列

CCG5Δ32是在第185個密碼子之后刪除了32個堿基。

由于每一個遺傳密碼子都是三個核苷酸組成有勾,刪除32個堿基,不是3的整數(shù)倍蔼卡,等于刪除了10個三聯(lián)堿基后還剩2個堿基,這樣荤懂,后面的密碼子都得重排。但是节仿,在93個堿基(表達31個氨基酸殘基)之后掉蔬,恰好出現(xiàn)了終止密碼子,提前結(jié)束表達女轿。

CCR5Δ32蛋白質(zhì)箭启,其氨基酸殘基比野生型少(352-185-31=136)個蛉迹,有216個氨基酸殘基,其相對分子質(zhì)量約為23800道爾頓荐操。比野生型少了很多。

第四小行:NANA CCR5+1的氨基酸序列

NANA 的CCR5+1是185個密碼子后插入了一個堿基對(A-T)淀零,圖2中用小寫字母表示的膛壹。插入屬于移碼突變。移碼突變將帶來重大的影響模聋。我們知道,每一個密碼子都是三聯(lián)堿基链方,不論你在任何位置插入一個(或者堿基數(shù)除以3余數(shù)為1或2)堿基灶搜,后面的密碼子都變了工窍。具體到NANA的密碼子,在第185密碼子之后患雏,經(jīng)過33個堿基(表達11個氨基酸殘基)之后,剩下的部分恰好跟CCR5Δ32剩下的序列重合淹仑。

NANA 的CCR5+1蛋白質(zhì)有227個氨基酸殘基,其相對分子質(zhì)量約為25000道爾頓匀借。

第五小行:NANA CCR5Δ4的氨基酸序列

NANA 的CCR5Δ4基因是在第185個密碼子+2個堿基對之后平窘,刪除4個堿基對。由于每個密碼子都是三聯(lián)堿基瑰艘,刪除4個堿基對,等于一個密碼子+1個堿基對磅叛,這樣第185個密碼子之后的密碼子就要重排了。重排的結(jié)果是弊琴,在30個堿基(表達10個氨基酸殘基)之后,出現(xiàn)了終止密碼子TAA紫皇。RNA在執(zhí)行表達任務(wù)時,遇到TAA聪铺、TAG萄窜、TGA就會停下來铃剔。核基因的遺傳密碼查刻,共有64個,其中61個可以編碼氨基酸殘基穗泵,3個終止密碼子。現(xiàn)在遇到TAA了佃延,蛋白質(zhì)表達到此結(jié)束夷磕。就算NANA 的CCR5Δ4基因還有一長串核苷酸,也等于“莫須有”坐桩,成為無用的核苷酸片段于未。見圖4撕攒。


圖4

這樣算下來抖坪,NANA 的CCR5Δ4蛋白質(zhì)只有195個氨基酸殘基,其相對分子質(zhì)量約為21500道爾頓擦俐,只有野生型的55%握侧。

綜上蚯瞧,LULU和NANA的CCR5基因型都是突變型品擎,其中有3個是缺失型移碼突變,1個是插入型移碼突變萄传。LULU 的等位基因是CCR5Δ32/Δ15,NANA的等位基因是CCR5Δ4/+1振诬。如果我們區(qū)分具體的突變,野生型和4種突變型可以視為5個復(fù)等位基因赶么,那么LULU和NANA兩位嬰兒都是突變雜合子脊串。我們現(xiàn)在不知道CCR5Δ32和CCR5Δ15或者CCR5Δ4和CCR5+1哪個是顯性基因,哪個是隱性基因洪规,但是我們可以肯定印屁,不管哪個是顯性基因,其表現(xiàn)型都是殘缺不全的CCR5跨膜蛋白。不過从橘,CCR5Δ15跟野生型較為接近础钠,CCR5Δ32叉谜、Δ4和+1跟野生型差距較大旗吁,殘缺得很厲害停局。四個突變的位置是在同一個膜段。

或者董栽,如果我們是以野生型為比較基準,那么兩位嬰兒又都可以視為突變型純合子锭碳。總之是不會有野生型的表達產(chǎn)物了推汽。只能得到殘缺不全的蛋白質(zhì)。

CCR5蛋白是一個7次跨膜蛋白歧沪,跨膜蛋白,要想正確表達功能暖夭,需要一二三四級結(jié)構(gòu)全部正確無誤才可以厢钧×鄱跨膜蛋白是一個構(gòu)象異構(gòu)體,可以根據(jù)信號改變構(gòu)象實現(xiàn)通道的開合寥假,特異病毒只能跟特異的構(gòu)象結(jié)合霞扬,否則是不能通過跨膜蛋白進入細胞膜內(nèi),攻擊細胞核的喻圃。

賀建奎副教授的基因編輯目標就是得到殘缺的CCR5跨膜蛋白,破壞HIV等病毒的輔助受體斧拍,使“LULU和NANA”獲得免疫力。另外,CCR5蛋白殘缺還有其他很多好處予权。擁有野生型CCR5蛋白反而可以視為一種準遺傳病。現(xiàn)在兩個嬰兒的CCR5跨膜蛋白果然都是殘缺的扫腺,應(yīng)該說初步完成了任務(wù)村象。

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