我這里使用python和biopython堡称,關(guān)于python和Biopython的安裝可以參考我的B站視頻
輸入文件就是葉綠體基因組的fasta文件瞎抛,經(jīng)過注釋你已經(jīng)知道LSC/IR/SSC的位置坐標,比如自己的葉綠體基因組序列
1——80000是大單拷貝區(qū)
80001——100000是反向重復(fù)區(qū)1
100001——130000是小單拷貝區(qū)
首先是輸出葉綠體基因組的總長度
輸出總的GC含量
大單拷貝區(qū)的GC含量
反向重復(fù)區(qū)
小單拷貝區(qū)
這里需要注意的是位置坐標是起始位置-1:終止位置
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小明的數(shù)據(jù)分析筆記本
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