最近需要下載一些核酸序列征字,之前介紹的ncbi-genome-download好像不能滿足我的需要,于是使用TBtools進行下載娇豫。
打開TBtools>Sequence Toolkit>NCBI Sequence Fetch>Bulk NCBI Sequence Download
粘貼accession號匙姜,設置好輸出文件夾和文件名,選擇對應的核酸格式即可冯痢,點擊Start.
下載得到一個fasta文件:
然后打開Sequence Toolkit > Fasta tools > Merge and split
把要分割的fasta文件拖進右邊第一個框,輸出的文件夾拖到右邊第二個框浦楣,Split Mode選擇Record Per line袖肥,再點擊Start,即可振劳。
如果使用腳本的話椎组,則只需
python split_multi_fasta.py -m ec_virus.fasta
也可得到單獨每一個fasta文件:
其實,使用命令行也很方便的历恐,當然圖形化界面能更直觀知道每一步該要什么寸癌,命令行只是把每一步輸入到命令里而已。用習慣了命令行夹供,其實也就不要害怕了灵份。