組蛋白結(jié)構(gòu)
在細(xì)胞核中所森,染色體是高度壓縮的囱持,而折疊時(shí)DNA纏繞的就是組蛋白。
將組蛋白區(qū)域放大必峰,我們就會看到這樣一串念珠洪唐,組蛋白被一根DNA序列串起來。
為了方便研究吼蚁,我們將一個(gè)組蛋白和其附近 147bp DNA片段凭需,叫一個(gè)核小體。也就是說肝匆,核小體 = 組蛋白 + DNA(147bp)
把組蛋白拆開來粒蜈,它其實(shí)有八個(gè)部分來構(gòu)成:
組蛋白八聚體 = 2個(gè)H2B + 2個(gè)H2A + 2個(gè)H3 + 2個(gè)H4
下面是檢測到的組蛋白三維結(jié)構(gòu)示意圖,可以看到旗国,每種組蛋白結(jié)構(gòu)都會伸出來一小段“線頭”枯怖,這是蛋白質(zhì)的N端,也叫尾巴(tail)能曾。
事實(shí)上度硝,每個(gè)組蛋白結(jié)構(gòu)都會延伸出這個(gè)“尾巴”,組蛋白修飾就是在這個(gè)尾巴上進(jìn)行的寿冕。
組蛋白修飾的描述規(guī)則
這種修飾時(shí)一種以共價(jià)方式進(jìn)行的蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTM)蕊程,包括:甲基化(M),磷酸化(P)驼唱,乙踉迕化(A)等等。
由于組蛋白修飾的類型眾多,所以我們需要在稱呼組蛋白修飾時(shí)辨赐,有一個(gè)規(guī)則:
組蛋白結(jié)構(gòu) + 氨基酸名稱 + 氨基酸位置 + 修飾類型
例如:
H3K4me3:代表H3組蛋白的第4位賴氨酸的三甲基化
H3K14ac:代表H3組蛋白的第14位賴氨酸的乙跤欧化
這些修飾都會影響基因的轉(zhuǎn)錄活性。而組蛋白H3是修飾最多的組蛋白掀序。
組蛋白修飾類型
甲基化(me)帆焕、乙酰化(ac)
這些組蛋白修飾也可以共同作用來完成調(diào)控森枪,比如视搏,H3K9ac也與H3K14ac和H3K4me3高度共存共同作為活性基因啟動子的標(biāo)志。
組蛋白修飾的檢測
一般我們使用 ChIPseq 來對樣本測序县袱,以此來拿到全基因組上的組蛋白修飾圖譜浑娜。