仍然還是那句話控汉,如果想要快速學(xué)習(xí)一門新的技術(shù),了解知識(shí)背景钟病,看中文文章更好萧恕,如果有碩博士畢業(yè)論文那則是最佳。
說到基因編輯技術(shù)肠阱,我一開始只知道
(A)CRISPR/Cas9 http://www.reibang.com/p/b9d2a7203e6c
在經(jīng)過一系列掙扎之后票唆,好不容易看懂了CRISPR/Cas9的原理,冷不丁冒出來一個(gè)(B)Cre/LoxP條件性敲除系統(tǒng)http://www.reibang.com/p/ccae8b289cab屹徘,到今天走趋,發(fā)現(xiàn)還有一個(gè)(C)FLP/FRT重組系統(tǒng)。
果然學(xué)習(xí)就跟人生一樣噪伊,并不是我猜中了開頭簿煌,沒料到結(jié)尾,其實(shí)是開頭也沒猜對(duì)鉴吹,過程更加意外姨伟,結(jié)尾至今還沒看到。
1. 背景
參考資料
https://zhuanlan.zhihu.com/p/29141696
http://c.biomart.cn/bioraylab/node/314
先復(fù)習(xí)一下CRISPR中的知識(shí)點(diǎn)豆励。
DNA雙鏈斷裂后夺荒,主要通過易錯(cuò)性的非同源末端連接(Non -homologous end joining, NHEJ)以及高保真性的同源重組(homologous recombination HR)進(jìn)行修復(fù),最終會(huì)造成基因敲入(knock in)良蒸、敲除(knock out)技扼、缺失(deletion)及基因修飾(gene modification)這幾種類型。
同源重組(百度百科):是指發(fā)生在非[姐妹染色單體(sister chromatin) 之間或同一染色體上含有同源序列的DNA分子之間或分子之內(nèi)的重新組合嫩痰』此ぃ看圖好了
非同源末端連接:是一種修復(fù)雙股DNA斷裂的方法。之所以是非同源性始赎,是因?yàn)閿嗔训膬啥问潜恢苯咏由虾统龋鞘褂昧艘粋€(gè)同源的模板。與之對(duì)比的同源性重組則需要一個(gè)同源序列來引導(dǎo)修復(fù)造垛∧д校“非同源性末端接合”這個(gè)詞是由Moore和Haber于1996年首創(chuàng)。
位點(diǎn)特異性重組:既然叫點(diǎn)五辽,則是小范圍內(nèi)的重組办斑。
2. 什么是FLP/FRT
位點(diǎn)特異性重組(site-specific recombination)技術(shù)是近 20 年來發(fā)展起來的一項(xiàng)重要的分子生物學(xué)技術(shù),該系統(tǒng)主要是通過借助能夠識(shí)別特異性位點(diǎn)的重組酶(site-specific recombinase杆逗,SSR)乡翅,在基因組上對(duì)外源 DNA 進(jìn)行操作,可以實(shí)現(xiàn)基因的置換罪郊、倒置和刪除等蠕蚜。FLP/FRT 系統(tǒng)就屬于位點(diǎn)特異性重組系統(tǒng)的一種。
FLP是一個(gè)重組酶(flippase悔橄,F(xiàn)lp)靶累,類似于Cre,它識(shí)別的位點(diǎn)是FRT癣疟,當(dāng)FRT在同一條DNA上且方向相同時(shí)挣柬,則兩FRT位點(diǎn)之間的基因則被刪除;FRT方向相反睛挚,則基因被倒轉(zhuǎn)邪蛔。
FRT:short flippase recognition target (FRT)
參考文獻(xiàn):
肖雪賓. FLP 重組酶表達(dá)載體的構(gòu)建及其在 FLP/FRT 系統(tǒng)中的應(yīng)用[D]. 吉林大學(xué), 2012.