本次演示使用的數(shù)據(jù)來(lái)自2017年發(fā)表于Cell的頭頸鱗癌單細(xì)胞文章：Single-Cell Transcriptomic Analysis of Primary and Metastatic Tumor Ecosystems in Head and Neck Cancer原探。本次演示提供處理好的測(cè)試數(shù)據(jù)，以及所有代碼扣猫，一共6個(gè)腳本（我目前寫得最詳細(xì)的教程毕荐，也是全網(wǎng)少有的）。
數(shù)據(jù)的預(yù)處理就不演示了冕碟，預(yù)處理的代碼存放在0.pre.R文件中拦惋。
以下是腫瘤細(xì)胞tsne圖和原圖的對(duì)比，和原文一致安寺，說(shuō)明前面的數(shù)據(jù)提取及處理是沒(méi)有問(wèn)題的厕妖。
最終的效果圖如下：
在準(zhǔn)備好數(shù)據(jù)之后，就可以開始NMF分析了挑庶。
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