CRISPR指數(shù): 可有效預測低級別膠質(zhì)瘤病人的預后

今天跟大家分享一篇2022年4月發(fā)表在Frontiers in Genetics (2020 IF=4.6)上的一篇文章但骨,題目為“A novel CRISPR/Cas9 screening potential index for prognostic and immunological prediction in low-grade glioma”浆劲。


摘要:

膠質(zhì)瘤是中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病中死亡率最高的一種惡性腫瘤。作者基于CRISPR/Cas9文庫献烦,采用CERES算法篩選出低級別膠質(zhì)瘤(LGG)的致死基因,利用ssGSEA來創(chuàng)建一個新的CRISPR/Cas9篩選潛力指數(shù)(CCSPI)來預測低級別膠質(zhì)瘤(LGG)的臨床結(jié)果和生物學特征卖词。文章將患者分層為低和高CCSPI組巩那。與低CCSPI個體相比吏夯,高CCSPI患者與訓練和驗證集的預后較差有關(guān)(P < 0.0001),且免疫分數(shù)較高即横。CCSPI系統(tǒng)具有良好的性能噪生,1年、3年和5年的AUC分別為0.816东囚、0.779跺嗽、0.724,nomogram模型的C-指數(shù)達到0.743(95%CI=0.725-0.760)页藻。免疫浸潤細胞和免疫檢查點如PD-1/PD-L1和POLD3與CCSPI呈正相關(guān)桨嫁。綜上所述,CCSPI對LGG有預后價值份帐,該模型將加深我們對不同LGG亞型的中樞神經(jīng)系統(tǒng)和免疫系統(tǒng)之間相互作用的認知璃吧。

DOI: 10.3389/fgene.2022.839884
第一作者:李祥攀
通訊作者:熊可為、趙晨
通訊單位:武漢大學人民醫(yī)院腫瘤科废境、華中師范大學數(shù)學與統(tǒng)計學學院

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
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