PMID: 33828074
雜志:Cell Death Discovery “小小CDD”
概述
細胞焦亡(Pyroptosis)指細胞的炎性壞死呼寸,屬于程序性細胞死亡屹堰。在病理性刺激下表現(xiàn)為細胞不斷脹大直到細胞膜破裂為止將細胞內容物釋放蛤铜,進而引起強烈的炎癥反應瞬内,在機體的抗感染的過程中非常重要藻治。炎癥和免疫反應在腫瘤微環(huán)境中作用顯著埋涧,因此作者決定探討下文獻中報道過的31個細胞焦亡相關基因在卵巢癌中的作用板辽。
結果
1.差異分析+PPI
2.一致性聚類
一致性聚類的目的主要是為了說明基因的重要性奇瘦,令我疑惑的是作者聚類后,跟預后沒啥關系劲弦,這個怎么解釋耳标?編輯不Cue嗎?
3.模型構建
常規(guī)的unicox+lasso+PCA
4.模型驗證
GSE140082芯片外部驗證模型可靠性邑跪。
5.模型周邊
unicox+multicox+富集分析+ssGSEA免疫細胞浸潤
總體來說次坡,本文一篇中軌中距的轉錄組預后數(shù)據(jù),且一致性聚類結果并不是很好画畅,能發(fā)到4+感覺運氣成分很大砸琅。個人理解本文最大的亮度在于從33個細胞焦亡基因出發(fā)。
參考鏈接:
A novel defined pyroptosis-related gene signature for predicting the prognosis of ovarian cancer