學(xué)習(xí)小組day3-jam(2020-11-18)
linux環(huán)境下的軟件安裝
生信環(huán)境通常使用miniconda即可(在家目錄下建立biosoft驾霜、project、backup瘦锹、pipeline、dataset、mvdata等文件夾分離管理各種文件)
通常去清華鏡像下載最新版miniconda
wget 下載鏈接 然后 bash miniconda.sh文件安裝 再source ~/.bashrc激活
添加鏡像
# 使用清華鏡像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes