單細胞空間多組學分析中的外顯子分析部分

作者，Evil Genius

之前分享了很多關(guān)于多組學的內(nèi)容了溃槐，其中涉及到外顯子的部分分析呢匣砖，我基本都一筆帶過了，很多高分文章都運用到了外顯子突變類的信息分析昏滴，以下為文章示例

示例一

示例二


示例三猴鲫，文章：A cellular and spatial atlas of TP53-associated tissue remodeling in lung adenocarcinoma
示例4、A spatial cell atlas of neuroblastoma reveals developmental, epigenetic and spatial axis of tumor heterogeneity
示例5


示例6

其中外顯子SNV的分析谣殊，主要還是集中在基因組層面拂共，我也寫過了很多文章

外顯子數(shù)據(jù)分析匯報匯總
外顯子拷貝數(shù)分析之cnvkit
外顯子數(shù)據(jù)分析之基因融合factora
腫瘤特檢關(guān)于cancer hotspot的簡單記錄
單細胞空間突變信息分析導論
腫瘤突變負荷（TMB）及計算方法
腫瘤突變位點臨床解讀數(shù)據(jù)庫：CIVIC、JAX CKB姻几、My Cancer Genome

以及分享了各種數(shù)據(jù)庫宜狐，我們要不要來一遍外顯子的分析課程？

課表已備好

第一節(jié)：外顯子分析基礎(chǔ)知識與框架
第二節(jié)：fastq數(shù)據(jù)處理到call SNV + 基礎(chǔ)認知
第三節(jié)（可能需要拆分成2節(jié)課）：各大數(shù)據(jù)庫如何注釋突變信息（clinvar蛇捌、cosmic抚恒、gnomad、HGMD络拌、hotspot 俭驮、oncoKB、md_aderson春贸、civic 表鳍、candl、my cancer genome祥诽、PMKB、intervar瓮恭、fathmm 數(shù)據(jù)庫的認知與運用）
第四節(jié)：TMB + MSI + Fusion + CNV
第五節(jié)：獲取生信文件如何進行用藥解讀
第六節(jié)：HRD + MRD

大約6~7節(jié)課吧雄坪，當然了，掏錢總是痛苦的屯蹦，我也一樣维哈，暫定1500吧，想報名的可以留言登澜，當然了阔挠，人少我們就不上了，正好休息休息脑蠕。

生活很好购撼，有你更好

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