今天在R語言上栽了跟頭。（哭
興高采烈地把原來的BEDRRBS文件變成滿足methylkit輸入格式的txt格式文件 特意把后綴名去掉了
昨天特意學(xué)習(xí)了sed gawk 等文件編輯工具边琉，今天又從頭做人學(xué)習(xí)如何將獲取文件名并且去掉后綴輸出到另外一個(gè)文件夾。
把文件傳輸?shù)奖镜刂蟾袷绞沁@樣沼瘫。
本地文件
起初瘋狂報(bào)錯(cuò)酝蜒。我用的是沒有后綴的文件名。然后我加上了后綴txt，CpG.txt恼蓬，還是不行惊完。然后開始翻methykit幫助文檔仔細(xì)閱讀，嘗試把myobj換成myobjDB处硬，當(dāng)然小槐，還是不行。反復(fù)退出Rstudio荷辕，重進(jìn)進(jìn)入凿跳，重新設(shè)定當(dāng)前工作路徑，均失敗疮方。
然后我就以為是自己文件問題控嗜，還一個(gè)一個(gè)查看了文件的表頭以及列信息等，確認(rèn)無誤案站。
一開始的R script
事情的轉(zhuǎn)機(jī)躬审。
點(diǎn)擊箭頭?
原來在R studio中看這些文件是這樣的棘街，會(huì)自動(dòng)加上后綴蟆盐。恩。剛從linux中過來遭殉，有點(diǎn)不太習(xí)慣石挂。
R studio中的文件名
按照這個(gè)寫文件名之后一切就work了。
希望自己以后可以冷靜思考险污，少犯這種錯(cuò)誤了嚶嚶嚶痹愚。
