發(fā)簡信
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vs code更改默認(rèn)終端 conda activate激活
緣起：今天想嘗試在vs code中使用python题造，出現(xiàn)了幾行warning借卧，大意是conda無法激活。 總結(jié)經(jīng)驗(yàn)： Anaconda可以看作是...
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Rnbeads包差異甲基化分析愚人節(jié)快樂噪漾。 導(dǎo)入數(shù)據(jù)，設(shè)置選項(xiàng) hESCs vshiPSCs 注釋文件路徑 告訴軟件測序數(shù)據(jù)是哪個平臺的數(shù)據(jù) 測序數(shù)據(jù)路徑（450K：idat...
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差異分析的檢驗(yàn)方法前言 眾所周知，當(dāng)你所自己今年比去年更優(yōu)秀的時候是不可以隨便吹牛的贰逾，請把你在簡書上發(fā)文的頻率以及質(zhì)量擺出來！ 面對今年和去年的數(shù)據(jù)菠秒，或許你需要一...
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如何從UCSC上下載注釋文件以及gene_id相互對照文件下載注釋文件（以hg19為例） 下載gene_id相互對照文件 UCSC上的注釋文件還是非常全面的疙剑，clade選擇大的分支，genome選擇物種...
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回家了践叠，bug來了[lt@localhost ~]$ java -version Error: dl failure on line 597 Error: fai...
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復(fù)盤總結(jié)（五）
今天做展示PPT的時候發(fā)現(xiàn)可以用一種更簡單的方式計(jì)算之前計(jì)算過的內(nèi)容言缤，因此更新一下之前的結(jié)果。1.相關(guān)性分析結(jié)果 2.組織特異性甲基化的啟動子區(qū)...
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復(fù)盤總結(jié)（四）
特異性分析 得到1495個組織特異性的啟動子甲基化區(qū)域禁灼。（由12118個啟動子甲基化區(qū)域得到）不重復(fù)的基因只有1392個管挟，有一些基因在不只一個組...
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復(fù)盤總結(jié)（三）GTEX表達(dá)矩陣預(yù)處理 R語言學(xué)習(xí)：1.append添加新的列。2.R語言處理大規(guī)模數(shù)據(jù)速度不算快弄捕，通過安裝其他包比如data.table可以提...
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復(fù)盤總結(jié)（二）
接復(fù)盤總結(jié)（一） methylkit R包上游處理 對甲基化位點(diǎn)進(jìn)行注釋僻孝、導(dǎo)出SPM分析上游文件 幾點(diǎn)說明：1.啟動子區(qū)域的選取：上下游250b...