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STRING數(shù)據(jù)庫是一個研究蛋白質(zhì)之間相互作用的數(shù)據(jù)庫吠卷，這種作用既包括蛋白質(zhì)之間直接的物理的相互作用当船，也包括蛋白質(zhì)之間間接的功能相關(guān)性
除了實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)外，STRING還包括了利用其它生物信息學(xué)方法預(yù)測得到的結(jié)果餐曼。該系統(tǒng)利用一個打分機(jī)制給予這些信息一個權(quán)重压储，并給出一個綜合的打分。
STRING數(shù)據(jù)庫
點(diǎn)擊SEARCH后會跳轉(zhuǎn)到一個檢索界面
檢索界面
在這個界面源譬，我們可以使用蛋白的名稱或序列對我們需要的蛋白質(zhì)進(jìn)行檢索集惋，也可以對多個蛋白或序列進(jìn)行檢索（見上圖左側(cè)邊欄）。下方的Organism文本框支持自動補(bǔ)全踩娘，如鍵入
homo s就會自動識別為Homo sapiens刮刑。點(diǎn)擊SEARCH就可以開始檢索了。
STRING檢索結(jié)果
以TP53為例养渴，第一個候選項(xiàng)即為我們要找的蛋白雷绢。點(diǎn)擊CONTINUE就可以顯示該蛋白的互作信息。
互作信息
如圖理卑，STRING已經(jīng)顯示了TP53與其他蛋白之間的互作關(guān)系翘紊。點(diǎn)擊圖像中的節(jié)點(diǎn)可以顯示基因的詳細(xì)信息。
基因信息
下方的按鈕提供了一些設(shè)置藐唠、分析的功能以及信息的說明帆疟。
- Viewers：更改圖形的樣式
- Legend：提供節(jié)點(diǎn)孵滞、邊、蛋白質(zhì)及其得分等信息
- Settings：對于圖形的設(shè)置鸯匹，可以調(diào)整邊的含義坊饶，按得分篩選節(jié)點(diǎn)，定制圖形的樣式殴蓬、修改圖片格式等匿级。修改完成后點(diǎn)擊UPDATE更新。
- Analysis：這部分包含兩塊內(nèi)容染厅，一塊是網(wǎng)絡(luò)的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)痘绎，包括邊和節(jié)點(diǎn)的數(shù)量等，另一塊是對于網(wǎng)絡(luò)的各種富集分析的結(jié)果肖粮，這些結(jié)果均可下載（在頁面的最底部）孤页。
- Export：以特定格式導(dǎo)出網(wǎng)絡(luò)，包括圖像涩馆、表格行施、XML等，既可以生成可直接使用的結(jié)果魂那，也可以導(dǎo)入其他軟件（如Cytoscape）進(jìn)行處理蛾号。
- Cluster：對網(wǎng)絡(luò)中的所有節(jié)點(diǎn)進(jìn)行聚類，支持K-Means和MCL兩種聚類方式涯雅。
