生信星球103期作業(yè)
Linux環(huán)境下軟件安裝
新手必備的軟件下載安裝小助手——conda
- 雖然現(xiàn)在網(wǎng)上很多人會說有比conda更好用的docker啥的，但那都是大佬們用的瞳秽，新人果然還是conda最香联予。
- conda的下載安裝與鏡像配置
- 這里用的是輕量級版的conda——miniconda
- 搜索“miniconda 清華”啼县，或直接進入鏈接
需要在多個版本中找到適合自己linux安裝的版本
要求：符合自己linux系統(tǒng)配置、最新
選擇
- 然后右鍵復(fù)制鏈接
- 進入linux中
cd biosoft
wget 鏈接
- 下載好后
bash 文件名
- 鏡像配置
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
- 軟件的安裝與卸載
- 首先在conda里查找
conda search fastqc
查找
- 如果出現(xiàn)總報錯的情況可以回到~目錄下沸久，
vi ./.condarc
然后在文件夾中刪除defult那行
安裝
conda install fastqc -y
安裝
- 刪除
conda remove fastqc -y
移除
