單細胞RNA測序(scRNA-seq)已經(jīng)徹底改變了生物和組織中細胞類型及其基因表達程序的特性叹卷。雖然細胞通量有了很大的提高楞陷，但這些方法通常存在低靈敏度和定量的問題惫确，且僅限于短RNA片段⊙冀颍現(xiàn)在，卡羅林斯卡學(xué)院的研究人員發(fā)布了Smart-seq3宽气，它極大地提高了scRNA-seq的質(zhì)量随常。這項研究發(fā)表在《自然生物技術(shù)》上。
Single-cell RNA counting at allele and isoform resolution using Smart-seq3
Smart-seq是生成單細胞RNA測序數(shù)據(jù)的最流行的方法之一抹竹。由于其高靈敏度和覆蓋RNA轉(zhuǎn)錄本的能力线罕，已被廣泛使用∏耘校卡羅林斯卡學(xué)院的科學(xué)家們現(xiàn)在已經(jīng)發(fā)布了Smart-seq3，這是一種對目前流行的Smart-seq單細胞檢測方法進行了高度改進的迭代喇闸，具有顯著提高的靈敏度(這意味著他們對細胞裂解前存在的所有rna進行了更大比例的測序)袄琳。重要的是，Smart-seq3還以5'端分子計數(shù)的新方法為特色燃乍，同時保留了完整的轉(zhuǎn)錄本覆蓋率唆樊，這使得計算重建已計數(shù)的RNA序列成為可能。擁有轉(zhuǎn)錄本的完整RNA序列可以揭示RNA是如何被處理的(例如刻蟹，通過編碼部分的選擇性剪接)逗旁，以及RNA是由母親還是父親的基因復(fù)制(等位基因)產(chǎn)生的。
Smart-seq 建庫區(qū)別： https://teichlab.github.io/scg_lib_structs/methods_html/SMART-seq_family.html
https://phys.org/news/2020-05-high-resolution-cell-single-cell-sequencing.html
https://www.nature.com/articles/s41587-020-0497-0
