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fastp 在2018 發(fā)表于bioinformatics 具體文章地址如下：
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/17/i884/5093234
fastp是一款非常棒的數(shù)據(jù)質(zhì)控的軟件搬男，可以過濾低質(zhì)量的reads合是，去除adapter 捣染，數(shù)據(jù)截取，生成質(zhì)控報告等等鳞青，由于其是C語言撰寫的，速度非掣昕龋快耳高。具體Github路徑如下：
https://github.com/OpenGene/fastp
fastp軟件參數(shù)說明如下：
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SE使用實例：
fastp -i BB127_P_1.fq.gz -o BB127_Lib1_Lane1_R1.fastq -A GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC -h BB127_filter.html
PE使用實例：
fastp -i reads.1.fq.gz -I reads.2.fq.gz -o clean.1.fq.gz -O clean.2.fq.gz -z 4 -q 20 -u 30 -n 10 -h stat.html
質(zhì)控報告產(chǎn)出如下：
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