NAC轉(zhuǎn)錄因子家族分析文章解讀

這是一篇今年4月25日發(fā)表在BMC Plant Biology(的NAC轉(zhuǎn)錄因子家族分析文章灾锯,文章內(nèi)容很簡(jiǎn)單蛙卤,一起來看一下具體內(nèi)容:

說起基因家族分析煮甥,不外乎以下分析內(nèi)容:

1鬓照、搜索基因家族成員蛋白保守結(jié)構(gòu)域乞榨,鑒定基因家族成員秽之;

2、預(yù)測(cè)基因家族成員的順勢(shì)作用元件吃既;

3考榨、構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹;

4鹦倚、基因家族成員MOTIF分析及繪圖河质;

5、基因結(jié)構(gòu)圖震叙;

6掀鹅、基因在染色體上的位置圖;

7媒楼、MCScanX共線性分析淫半,繪制基因組內(nèi)基因家族成員共線性circos圖;

8匣砖、計(jì)算串聯(lián)重復(fù)基因的KA/KS;

9昏滴、選定的其他物種進(jìn)行基因家族成員同源性分析猴鲫;

10、結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)繪制該基因家族的表達(dá)量熱圖谣殊。

那么說到這篇NAC轉(zhuǎn)錄因子家族文章拂共,都做了哪些工作呢?

一姻几、NAC家族基因鑒定

二宜狐、NAC家族基因結(jié)構(gòu)和motif分析

三、NAC家族系統(tǒng)發(fā)育分析

四蛇捌、和其他物種的同源性分析

五抚恒、NAC家族加倍事件分析和共線性分析

六、KA/KS分析NAC家族重復(fù)事件

七络拌、結(jié)合干旱和冷脅迫下轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行NAC家族基因表達(dá)分析俭驮,并分別挑選基因進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)

以上即是該文章的所有實(shí)驗(yàn)和分析內(nèi)容,最后加上相應(yīng)的討論,一篇3分2區(qū)的文章就完成了混萝,是不是很簡(jiǎn)單遗遵?

總的來說,這篇文章的分析內(nèi)容比較常規(guī)(全部包含在我們列出的10條分析內(nèi)容之中)逸嘀,實(shí)驗(yàn)方面還是以定量驗(yàn)證為主车要。這也說明基因家族分析類文章依舊火熱,并不過時(shí)崭倘,不過想發(fā)這類文章的朋友還是得抓緊了翼岁。

《基因家族分析》課程鏈接:

https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705

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