生信 | 三維基因組技術(一):簡單介紹

寫在前面

  • 以下內容均來自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培訓班上記錄的課堂筆記

1.基因組空間三維結構與功能

  • 染色質空間三維結構
  • 染色體結構
    DNA以一長串復雜的線圈形式堆積成染色體。DNA各線圈纏繞在若干組蛋白束上形成“串珠”結構厨喂。這些線圈構成一個染色質鏈。然后染色質折疊成許多環(huán)钮热,再卷曲形成一個染色體。
染色體結構

染色質空間三維結構
  • 真核生物細胞核內染色質結構
真核生物細胞核內染色質結構
  • 原核生物細胞內擬核結構
原核生物細胞內擬核結構
  • 基因組結構與功能的關系

基因組在空間上形成特定的結構后發(fā)揮特定的功能烛芬,如基因組上的Enhancer通過折疊成環(huán)促使基因的表達等

loop結構與功能
loop結構與功能

2.三維基因組技術簡介

  • 三維基因組手段是破解遺傳機理的“關鍵鑰匙”隧期,通過三維基因組的手段來解析玉米中順式調控元件的作用機制顯得尤為重要
  • 三維基因組技術組成
三維基因組技術組成
  • 三維基因組學發(fā)展
三維基因組學發(fā)展
  • C系列技術起始——3C
3C
  • C系列技術——4C
4C
  • C系列技術——ChIA-PET
ChIA-PET
  • C系列技術——Hi-C
Hi-C
  • 三維基因組技術對比

整體思路:交聯-酶切-連接-檢測


維基因組技術對比

3.三維基因組技術應用

三維基因組技術應用
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