首先放一張測(cè)序示意圖阅嘶，在DNA片段兩端所加的序列即接頭序列，也就是我們今天要講述的主角魂迄。
1 基本概念
1.1 adapter
接頭，為一段已知的短核苷酸序列湿酸，用于鏈接未知的目標(biāo)測(cè)序片段
1.2 index或barcode
幾個(gè)堿基組成的寡核苷酸鏈稿械，用于在混合測(cè)序時(shí)，區(qū)分不同樣本
1.3 insert
待測(cè)序的目標(biāo)序列厢呵，位于兩個(gè)adapter之間
測(cè)序片段包括幾個(gè)部分：universal_adapter-insert-indexed_adapter。
測(cè)序由5'端開(kāi)始寒砖，最開(kāi)始的幾個(gè)堿基無(wú)法測(cè)得，第一個(gè)adapter在數(shù)據(jù)輸出時(shí)去除漠嵌，由于測(cè)序讀長(zhǎng)的限制儒鹿，第二個(gè)adapter通常測(cè)不到约炎。
但是如果插入片段本身較短掠手，測(cè)序會(huì)測(cè)穿，即會(huì)得到 insert-部分adapter 這樣的read府寒，這里的adapter便是我們常常提到的需要去除的接頭部分。
2 序列信息
2.1 接頭序列（示例）
universal adapter:
5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3’
indexed adapter:
5’-GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC(barcode)ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’
仔細(xì)看上面這對(duì)接頭序列纤房，universal adapter的3'末端的T與待測(cè)片段新增的A配對(duì)炮姨，那么剩余序列的反向互補(bǔ)鏈為
GATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTAGATCTCGGTGGTCGCCGTATCATT
與 indexed adapter 的前面12個(gè)堿基一致
GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC，即兩段接頭序列部分互補(bǔ)蛾派，形成Y型的結(jié)構(gòu)洪乍。
2.2 index序列
可根據(jù)fastq序列中的信息獲取
@HWI-ST1276:71:C1162ACXX:1:1101:1208:2458 1:N:0:CGATGT
fastq的格式信息不再贅述，第一行最末的 CGATGT 即本次測(cè)序所使用的index钾埂。
