16世紀(jì)末国章，科學(xué)的理念開始傳播，漸漸沖破了宗教的迷霧豆村。
伽利略提出一種機械論學(xué)說液兽，認為自然法則，也就是掌管整個物理世界的法則掌动，是遵循數(shù)學(xué)原理的四啰。
集數(shù)學(xué)家、神學(xué)家粗恢、音樂理論家和修道士于一身的馬林·梅森非常贊同伽利略的觀點柑晒，他經(jīng)常在他的蘭尼修斯修道院的小房間里招待來自歐洲各地的知名學(xué)者和科學(xué)家。
在梅森討論會上有一位叫皮埃爾·伽桑狄的法國科學(xué)家眷射，他認為存在兩種靈魂：一種靈魂由原子組成匙赞，產(chǎn)生自神經(jīng)系統(tǒng)和大腦佛掖，能夠感知外界、感受快樂和痛苦并進行決策涌庭；另一種是非物質(zhì)的理性靈魂芥被，這種靈魂能夠進行自我反思，或者產(chǎn)生身體感覺以上的高級感知坐榆。
在梅森討論會上還有一位更加著名的哲學(xué)家拴魄、數(shù)學(xué)家勒內(nèi)·笛卡爾，前文提到席镀，是他第一個提出了現(xiàn)代意義的意識概念匹中。
當(dāng)時，巴黎的法國皇家公園里有一個由水力驅(qū)動的自動機豪诲，能夠活動顶捷、發(fā)出聲音，甚至彈奏樂器屎篱。這極大地吸引了笛卡爾的興趣焊切，他覺得這些仿佛具有理性，能夠進行自主運動的機器和我們的身體何其相似芳室。
他認為，這就好像反射運動刹勃，受環(huán)境刺激誘發(fā)預(yù)先設(shè)定好的運動堪侯，而并不需要靈魂的指引。他甚至將這種反射行為擴展到情緒荔仁、認知乃至記憶的反應(yīng)伍宦。
但是，將這種機械性應(yīng)用到人類身上時乏梁，這太令人難以接受了次洼。難道說自由意志不存在？我們無法對自己的行為負責(zé)遇骑？道德和罪惡是否還成立卖毁？我們其實是一臺機器？
為了打破這種尷尬落萎，笛卡爾最終得出了一個結(jié)論亥啦，他認為身體遵循物理法則，但人類的行為由另外一種自主的物質(zhì)——非物質(zhì)的理性靈魂所引發(fā)练链，這種靈魂擁有意識和自由意志翔脱，能夠進行抽象的思考，會提出質(zhì)疑媒鼓，并且具備道德觀念届吁。
這就是著名的“身心二元論”错妖，即身體由物理結(jié)構(gòu)組成，而心智由非物理（非物質(zhì)）的認知結(jié)構(gòu)組成疚沐。他甚至自以為找到了心智和大腦互動的節(jié)點：松果體暂氯。
他在《沉思錄》中提到了“意識”一詞，并用它來指代我們對自身想法的認識濒旦。這一觀點在過去350年間牢牢束縛住了哲學(xué)家們的思想株旷。
此后50多年，很多優(yōu)秀的學(xué)者加入到對意識的研究中來尔邓。
梅森沙龍上的另一位學(xué)者托馬斯·霍布斯反對笛卡爾對靈魂的描述晾剖，他認為理性并非產(chǎn)生自某種神秘的非物質(zhì)，它無非是身體用以維持大腦秩序的一種能力梯嗽。
一開始齿尽，霍布斯提出了一個理論，認為感覺能夠產(chǎn)生壓力灯节，從而引起心臟的跳動循头。他找到了一名助手——年輕聰明的英國醫(yī)學(xué)生威廉·配第，在這名助手的幫助下炎疆，他做了大量的實驗卡骂，最終卻沒有證明這個理論的正確性，于是他放棄了這個理論形入。
這位年輕的助手配第深受他這種求實的科學(xué)精神的影響全跨，在離開霍布斯后成為了著名的解剖學(xué)家，并且他幫助了另一名年輕醫(yī)生托馬斯·威利斯同樣成為了著名的解剖學(xué)家亿遂。
配第后來轉(zhuǎn)行成為了著名的經(jīng)濟學(xué)家浓若，但威利斯卻繼續(xù)在大腦的研究中取得了成就。他與克里斯托弗·雷恩合作向狗的頸動脈注射墨水和番紅花染料蛇数，從而勾勒出整個腦部的血管系統(tǒng)挪钓。
威利斯首次確定了腦底血管結(jié)構(gòu)的功能，因此耳舅，這一結(jié)構(gòu)被命名為“威利斯環(huán)”碌上。威利斯和雷恩一起繪制了迄今為止最精確的人類大腦圖譜，發(fā)表在著作《大腦解剖》中浦徊。
通過大量的科學(xué)實驗绍赛，威利斯最終同意人類的生命活動中并沒有所謂靈魂的參與。他發(fā)現(xiàn)血液從空氣中提取某種物質(zhì)并將其傳輸給肌肉辑畦，從而成為軀體的驅(qū)動力吗蚌。
但是，他無法在身體中找到理性思維的生理歸屬纯出，所以他只能采納了伽桑狄的觀點蚯妇，認為理性思維是非物質(zhì)的敷燎，同時他也同意笛卡爾的看法，相信思維位于大腦箩言。
他認為神經(jīng)負責(zé)從外界獲取感覺硬贯，動物的靈魂隨后將感覺運往大腦。來自各處的靈魂跟隨神經(jīng)通路來到大腦深處陨收，最后匯聚在一個中央地帶饭豹，即連通左右半球的巨大神經(jīng)束：胼胝體。
在人類理解意識的征途中务漩，威利斯是一個重要人物拄衰。他是首批將特定大腦損傷與特定行為障礙聯(lián)系起來的學(xué)者，同時他還認識到大腦不同區(qū)域負責(zé)不同的任務(wù)饵骨。
他認為腦能夠在不同區(qū)域而非單一腦區(qū)自動完成多個任務(wù)翘悉；他還描述了大腦的信息交流通道，只不過他尚未認識到通道中傳輸?shù)闹皇请娦盘柧哟ィ皇撬J為的靈魂妖混。因為，在他那個時代轮洋，人類還沒有發(fā)現(xiàn)電制市。
