發(fā)簡信
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研究生一枚粮彤，主要研究方向?yàn)橹参飪?nèi)生菌及微生物相關(guān)內(nèi)容兵志，公眾號【科研后花園】醇蝴，主要更新內(nèi)容：1）基于R的科研繪圖；2）科研小技巧分享想罕；3）繪圖技巧分享悠栓；4）科研網(wǎng)站分享。
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RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)（二）：上游數(shù)據(jù)的比對計(jì)數(shù)——Hisat2+ featureCounts 與 Salmon本節(jié)概覽：hisat2 + featureCounts:獲取hisat2索引文件描睦，hisat2比對和samtools格式轉(zhuǎn)化妖谴，featureCounts計(jì)數(shù)得到counts表...
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RNA-Seq數(shù)據(jù)分析：cutadapt+hisat2+samtools+stringtie+deseq2
參考教程： Griffith Lab tutorial[https://rnabio.org/course/] raw data/PF data/Q30 data/clean...
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轉(zhuǎn)錄組分析流程概念及類型： 轉(zhuǎn)錄組（transcriptome）廣義上指某一生理?xiàng)l件下膝舅，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA窑多、核糖體RNA仍稀、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRN...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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【R 基礎(chǔ)】補(bǔ)充篇 轉(zhuǎn)錄組分析儲備1 介紹R及R Studio 右上角history舞箍，To Console選擇到左下角，To Source選擇到左上編輯器內(nèi)皆疹。 畫圖沒出圖：dev.off 包的安裝路徑：.li...
