輸出和你一樣的定量文件后，可以不用sleuth做后續(xù)分析，用DEque2做后面的分析嗎，如果可以，具體方法是怎樣的呀????，可以分享一下不
kallisto比對(duì)參考轉(zhuǎn)錄組kallisto是2016年發(fā)表在Nature Biotechnology上的一個(gè)比對(duì)工具，可以將bulk或者single-cell RNA-Seq數(shù)據(jù)的序列直接比對(duì)到轉(zhuǎn)錄組...
IP屬地：山西
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你這上面只有如何導(dǎo)入文件做DEseq2分析中剩，后面的該怎么做呀
RNA-seq:Kallisto+Sleuth (2)
Kallisto下游推薦的分析軟件是Sleuth，所以我們本次介紹如何使用Sleuth進(jìn)行相關(guān)的分析抒寂。 RNA-seq在完成轉(zhuǎn)錄本的鑒定及定量后结啼，我們經(jīng)常做的分析之一就是差異...
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你好，我還想問一下屈芜，Kallisto定量輸出的幾個(gè)文件怎樣做DEseq2分析呀妆棒，有代碼分享嗎????
RNA-seq:Kallisto+Sleuth (2)
Kallisto下游推薦的分析軟件是Sleuth，所以我們本次介紹如何使用Sleuth進(jìn)行相關(guān)的分析沸伏。 RNA-seq在完成轉(zhuǎn)錄本的鑒定及定量后糕珊，我們經(jīng)常做的分析之一就是差異...
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愿同你一起分享在生信分析和精品咖啡上的點(diǎn)滴红选！
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你好，estcount怎么轉(zhuǎn)換成rawcount呀
【轉(zhuǎn)錄組學(xué)】如何進(jìn)行一步到位的fastq到差異分析姆另，kallisto拯救你(一)
傳統(tǒng)轉(zhuǎn)錄組的分析想必大家已經(jīng)非常熟悉喇肋，無(wú)非是質(zhì)控 -> 比對(duì) -> 組裝 ->定量 -> 差異分析 -> 差異表達(dá)基因功能富集分析這個(gè)套路。目前公司用的流程主要也有兩個(gè)門派迹辐，...
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你好明吩，我用以上代碼差異分析出來只有20個(gè)差異基因间学，正常不
使用salmon和sleuth進(jìn)行小麥RNA-seq差異表達(dá)分析
blast大家一定熟悉吧, 最近有大神爆出一個(gè)bug。也即參數(shù)“-max_target_seqs”并不是你理解的那樣印荔。下圖紅色箭頭處是NCBI上的設(shè)置選項(xiàng)低葫。根據(jù)NCBI的官方...
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你好，我想問一下仍律，我用這個(gè)代碼做出來的差異基因只有20幾個(gè)嘿悬，是不是有問題呀
RNA-seq:Kallisto+Sleuth (2)
Kallisto下游推薦的分析軟件是Sleuth，所以我們本次介紹如何使用Sleuth進(jìn)行相關(guān)的分析水泉。 RNA-seq在完成轉(zhuǎn)錄本的鑒定及定量后善涨，我們經(jīng)常做的分析之一就是差異...
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