發(fā)簡信
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比對軟件（DNA or RNA序列）的區(qū)別
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用僧叉，有錯誤請指出叉讥，我立刻改正侍郭！ 更多說明：https://zhuanlan.zhihu.com/p/451939113[https://zhuanla...
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利用Biopython來進行序列比對
作者：童蒙編輯：angelica 前言 序列比對在生物信息中很常見鸠珠，通過比較序列的相似度來推測其相關(guān)的功能遗淳。序列比對一般針對的是兩條或者多條序列变泄，可以是DNA令哟、RNA或者蛋白...
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公號：Python大數(shù)據(jù)分析励饵，關(guān)注送10G資料
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Github上5個實用的ChatGPT倉庫ChatGPT是一款基于聊天場景的大模型AI驳癌，最近火出圈。 Chat表示聊天役听，GPT表示大模型算法颓鲜，它通過生成式的人機對話功能，讓使用者第一次有了AI機器人‘懂我‘的感覺典予，而...
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R語言 如何合并2個單boxplot為1個多組boxplot(boxplot-multiple-group）某一天甜滨，我生成了2個箱圖boxplot，突然間老師要求合并成1個箱圖瘤袖，唉～～～于是我各種查資料衣摩，學(xué)著做這種分組plot，結(jié)果如上圖所示捂敌，主要想用多組boxplot展示同組數(shù)據(jù)...
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免疫組庫分析實戰(zhàn)/mixcr+vdjtools+R實現(xiàn)使用《OncoImmunology》一篇paper中的數(shù)據(jù)進行實戰(zhàn) 數(shù)據(jù)獲取地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB3...
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免疫學(xué)筆記第03篇-抗原呈遞
前言 這是《How the immune system works 6th》（中文名是《免疫學(xué)概覽》）讀書筆記的第3篇占婉，主要內(nèi)容是抗原呈遞泡嘴。 什么是MHC 在上一篇筆記中我們...
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利用TRUST4從bulk RNA-seq中重構(gòu)免疫組數(shù)據(jù)
昨天老師發(fā)給我一篇生信女神Shirley Liu的文章，看了里面的內(nèi)容之后感覺很興奮～它可以不做免疫組測序逆济，直接從Bulk RNA-seq或者scRNA-seq里面重構(gòu)得到免...
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獨立開發(fā)者奖慌，終身學(xué)習(xí)者抛虫，喜歡交朋友，歡迎討論简僧，共同成長建椰，一起進步。
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vdjtools處理mixcr數(shù)據(jù)-實戰(zhàn)篇immune repertoire sequencing data (RepSeq data)免疫組庫數(shù)據(jù) vdjtools 分析流程: vdjtools 目前版本是1.2....
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ensembl等基因id簡介及轉(zhuǎn)換想了解ID轉(zhuǎn)換的ID類型涎劈，打開ncbi广凸，類型下拉選擇gene，搜索tp53蛛枚，隨便進入一個谅海，如https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7157[ht...
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一文學(xué)會 | Seurat2整合不同技術(shù)的單細胞測序數(shù)據(jù)并去除批次效應(yīng)摘要：不同的測序平臺或同一平臺不同樣本得到的測序數(shù)據(jù)需要去除批次效應(yīng)后進行整合分析，擬采用Seurat2程序包對CelSeq蹦浦，CelSeq2扭吁，F(xiàn)luidigm C1，SMAR...
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R語言學(xué)習(xí)--data.table-fread函數(shù)
參考：https://cran.r-project.org/web/packages/data.table/data.table.pdf 描述 "freda" 用于常規(guī)分隔文...
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使用immunarch包進行單細胞免疫組庫數(shù)據(jù)分析（六）：Gene usage analysis基因使用計算 immunarch包帶有一個基因片段數(shù)據(jù)表蝌诡，其中包含了遵循IMGT[http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/LocusGenes/...
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個人公眾號<br><br>公眾號：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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公眾號 生信小課堂
