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發(fā)簡(jiǎn)信
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TwoSampleMR 遇到的坑
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TwoSampleMR：兩樣本孟德爾隨機(jī)化孟德爾隨機(jī)化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系[http://www.reibang.com/p/8ac31267d3d8] 主要步驟：1. 讀取暴露因素GWAS數(shù)據(jù)選取合適...
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感興趣各種統(tǒng)計(jì)技巧，統(tǒng)計(jì)軟件，數(shù)據(jù)處理飒箭，問卷分析和模型構(gòu)建。<br><br>有心理學(xué)和醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)背景，有問題請(qǐng)私信弦蹂。
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數(shù)據(jù)處理，分析與展現(xiàn)削饵，R語(yǔ)言編程岩瘦，Python, 圖表制作，基于數(shù)據(jù)的決策與執(zhí)行,算法窿撬。Life is short, use Linux.
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孫振球, 徐勇勇. 醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué).第4版[M]. 人民衛(wèi)生出版社, 2014. 從R語(yǔ)言和統(tǒng)計(jì)學(xué)小白的過(guò)渡劈伴。密末。。 更加優(yōu)質(zhì)的閱讀體驗(yàn)：https://x2yline.github.io/statistics_note/ 簡(jiǎn)書不支持latex語(yǔ)法跛璧。严里。。
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數(shù)據(jù)處理很重要呀，得學(xué)座柱！
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R語(yǔ)言與統(tǒng)計(jì)分析專題色洞，注重R語(yǔ)言編程與統(tǒng)計(jì)分析的交互式學(xué)習(xí)和思考
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專注生信基礎(chǔ)知識(shí)，包括測(cè)序原理惭蹂，測(cè)序名詞解釋及各種概念伞插！
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個(gè)人學(xué)習(xí)生信的一點(diǎn)心得 歡迎討論指摘
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農(nóng)學(xué)跨生信，之前總覺得苛聘，沒人教涂炎，怕走彎路忠聚，遲遲不肯踏踏實(shí)實(shí)從基礎(chǔ)一點(diǎn)一點(diǎn)積累慢慢學(xué)起。一會(huì)看看生物唱捣，一會(huì)寫寫代碼两蟀，抓不住重點(diǎn)也沒有提高。 后來(lái)關(guān)注了生信技能樹震缭，還蹭了建設(shè)人Jimmy大佬組織的線下聚會(huì)赂毯，聽到幾位大佬介紹后，發(fā)現(xiàn)他們都是自學(xué)拣宰，自己摸索的欢瞪，并且給我強(qiáng)調(diào)了記筆記的重要性。 這是一個(gè)對(duì)知識(shí)管理的過(guò)程徐裸，記錄下學(xué)習(xí)的一點(diǎn)一滴遣鼓，寫下來(lái)的筆記是給自己的（有時(shí)候會(huì)覺得寫的不好，也不敢分享出來(lái)重贺，沒有正向激勵(lì)骑祟，漸漸就不寫了），當(dāng)然如果也可以像大佬們那樣對(duì)他人的學(xué)習(xí)起到幫助气笙，我也會(huì)覺得非常榮幸和開心吶次企。 加油啦～～
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生信在線數(shù)據(jù)庫(kù)
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生信精讀文獻(xiàn)
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一些生物信息學(xué)用到的軟件踏志，工具，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測(cè)序組裝使用的Spades胀瞪、canu等等 ?? 序列比對(duì)比如blast针余、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對(duì)比如mega凄诞、clustalW圆雁、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS帆谍、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹構(gòu)建工具IQtree伪朽、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 ?? 尋找測(cè)序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK既忆、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o驱负、QIMME ?? 測(cè)序質(zhì)量評(píng)估的FastQC嗦玖、BUSCO、QUAST ?? 可視化工具比如IGV跃脊、3D Genome ?? 測(cè)序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit宇挫、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
