EndHic 想比較HiC-Pro箫爷，EndHic的安裝就簡單很多蔬浙，就是下載即可用 EndHiC的安裝 要用到的腳本都在文件夾下，直接調用就行 怎么使用呢骄噪？不得不說一下，git...
發(fā)簡信
IP屬地：臺灣
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hicPro+EndHiC(二)染色體掛載
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卑微的生信人，如果我的帖子對你有幫助瓢对，麻煩點點贊哦
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并沒有看到與疾病如何關聯(lián)的分析過程
hdWGCNA系列推文（二）：分析單細胞轉錄組數據
前言 Immugent在hdWGCNA系列推文第一篇：hdWGCNA：將單細胞和空間轉錄組的WGCNA分析變成現(xiàn)實[https://mp.weixin.qq.com/s?__...
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4 比對到參考基因組輸出bam文件
進到align目錄對質量好的測序數據進行比對 1. 一個個比對秧荆，生成BAM文件 align目錄 不用-R參數也可以執(zhí)行，但后面gatk的時候會報錯 2或者循環(huán)批量比對 增加第...
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3_0_4 要理解并會用的幾個腳本
這個介于3和4之間埃仪，目的是練習幾個有用的腳本乙濒，學幾個命令。 隨便找?guī)讉€文件進行練習卵蛉，只是為了說明問題颁股，這些其實是RNA-seq數據，但無所謂傻丝，只是看腳本的處理有以下幾個文件 ...
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3 wes測序質量的控制原視頻6:測序質量的控制首先建立文件夾 這部分包括fastqc和multiqc兩個軟件查看測序質量甘有，以及使用trim_galore軟件進行過濾低質量reads和去除接頭。 1...
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hdWGCNA：單細胞WGCNA分析方法WGCNA原理和分析流程[http://www.reibang.com/p/9331eb5377d1] 單細胞WGCNA分析方法+隨機森林[https://www.jian...
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如何合并兩個或多個bed files
目的：把兩組bed files 分別pool成一個bed file，而且疊加到序列區(qū)間要merge起來该互。合并：cat *.bed > output.bed軟件：需要 bedt...
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UKBB數據下載流程（第一節(jié)）
從今天開始米者，我又要經常回到簡書記錄一些數據下載宇智，處理流程了蔓搞。目前需要UKBB的GWAS， 用的人很多随橘，都是大文章喂分，大手筆。我沒有找到怎么下載的机蔗。所以打算自己跟著幫助文檔學習一...
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phesant（PHEnome Scan Analysis Tool）想著好久沒更新了咱枉，但我的粉絲們還是會經常來看看我卑硫，所以，決定把最近學的東西掛出來蚕断。 搜了下中文網欢伏，幾乎沒有對這個方法進行介紹的，一個可能是新出的基括，一個可能是手里沒有大樣本颜懊，不...
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起個詳亮的名字 ·Note that if Boost is installed in a non-default location then its path should be specified with BOOST_ROOT in the cmake command above:
$ cmake -DBOOST_ROOT=/path/to/boost/ ..
If all of the above steps were successful, the build directory now contains ExpansionHunter executable. -
DaPars——APA分析3’UTR
Backgroud APA（alternative polyadenylation）在大多數人類基因的轉錄后調控中發(fā)揮著重要作用。通過使用不同的多聚腺苷酸化(poly(A))...
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@laroseblanche 并沒有
nature級別圖表：單細胞轉錄組細胞比例統(tǒng)計可視化函數
單細胞轉錄組細胞比例： 關于單細胞比例的計算和作圖我們之前出過3期风皿，單細胞比例的展示是很多單細胞文章必不可少的內容：跟著Cell學單細胞轉錄組分析(六):細胞比例計算及可視化...
