IP屬地：黑龍江
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Neoantigen Prediction
High-resolutionHLA typingwas performed computationally usingSOAP-HLA fro...
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TCR CPK
T細(xì)胞(TCR)克隆多樣性的指標(biāo)(CPK) 一、CPK是什么 CPK就是一個(gè)衡量蠢终，T細(xì)胞(TCR)克隆多樣性的指標(biāo)[Ref1]塞琼。它越高就說(shuō)明文庫(kù)...
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TCRTRUST 1裁厅、概述 TRUST步清，是從RNA-seq原始數(shù)據(jù)組裝到TCR CDR3的軟件跪楞，專門為RNA-seq數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)的工具[Ref1]誊薄。 它是...
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HLA Typing# 函數(shù)功能簡(jiǎn)介：使用HLA-HD軟件來(lái)識(shí)別HLA typing # 創(chuàng)建作者: Van Linun # 日期：2020/9/7 #######...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 7 pVACSeq pVACtools pVACtool是一個(gè)癌癥免疫治療工具套件获茬，由四個(gè)工具組成港庄，分別是pVACseq、pVACfu...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 6 VATools 簡(jiǎn)介 VAtools是一個(gè)包含多個(gè)注釋VCF文件工具的python模塊恕曲。VAtools 包含vcf-readcou...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 5 VEP 簡(jiǎn)介 VEP(Variant Effect Predictor)是ENSEMBL制作的一個(gè)專門對(duì)突變數(shù)據(jù)添加注釋信息的工具...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 3 Samtools view view命令的主要功能是：將sam文件轉(zhuǎn)換成bam文件攘轩；然后對(duì)bam文件進(jìn)行各種操作，比如數(shù)據(jù)的排序(...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 2 BWA 一码俩、建立索引 $ bwa index -a bwtsw human.fa -a [is|bwtsw] : 輸入構(gòu)建Inde...