基因-共線性的定義與常見(jiàn)算法原理 物種內(nèi)的共線性分析文件準(zhǔn)備（物種比對(duì)到自身的.blast文件燃少，物種基因信息文件.gff文件）者娱，運(yùn)行MCScanX无宿，輸出collinear和t...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程(3)基因家族成員的進(jìn)化分析2 -
TBtools基因家族分析詳細(xì)教程(2)基因家族成員的基本分析包括基因成員的序列特征分析（分子量等電點(diǎn)等）基于motif分析成員序列保守特征與可視化（蛋白與核酸敏释，可用于挖掘未知暇检，尤其是核酸水平-非編碼水平的保守）基于domain分析成員...
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巨坑用踩！真的不要拿著 BLAST 就開(kāi)始篩同源基因~寫(xiě)在前面 現(xiàn)在是 08:42，上午江解，還有30分鐘就要趕去暑期培訓(xùn)會(huì)場(chǎng)（廣西南寧-含線上場(chǎng)）设预，想著今天應(yīng)該一天都挺忙，干脆這會(huì)簡(jiǎn)單寫(xiě)一個(gè)昨晚碰到的用戶(hù)的有趣問(wèn)題犁河。 不要拿 BL...
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講演推介 | GSAman人工矯正基因結(jié)構(gòu)注釋神器鳖枕！寫(xiě)在前面 前述確定下來(lái)參與 CGMonline 首次線下年會(huì)，原本以為是去做個(gè)報(bào)告桨螺，后面提了做個(gè)技術(shù)培訓(xùn)宾符，最后定下來(lái)是只做會(huì)前的技術(shù)培訓(xùn)。本次報(bào)告人非常多彭谁，據(jù)說(shuō)每個(gè)人不到15...
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老師吸奴，您這個(gè)下載地址打不開(kāi)的，沒(méi)辦法下載SSRMMD軟件
使用SSRMMD便捷缠局、迅速與準(zhǔn)確地進(jìn)行：SSR位點(diǎn)檢測(cè)则奥，多態(tài)性SSR篩選，與批量SSR引物設(shè)計(jì)
1.簡(jiǎn)介 SSRMMD (Simple Sequence Repeat Molecular Marker Developer) 是用Perl語(yǔ)言編寫(xiě)的軟件狭园，可以從組裝序列（F...
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使用SSRMMD便捷读处、迅速與準(zhǔn)確地進(jìn)行：SSR位點(diǎn)檢測(cè)，多態(tài)性SSR篩選唱矛，與批量SSR引物設(shè)計(jì)
1.簡(jiǎn)介 SSRMMD (Simple Sequence Repeat Molecular Marker Developer) 是用Perl語(yǔ)言編寫(xiě)的軟件罚舱，可以從組裝序列（F...
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疑惑解決 | 關(guān)于“重現(xiàn) Nature Plant 番茄分支位點(diǎn)鑒定的 BSAseq 分析結(jié)果”前述，我們推了一份教程绎谦，《QTLseq數(shù)據(jù)分析管闷，鼠標(biāo)點(diǎn)點(diǎn)，復(fù)現(xiàn) Nature Plant 番茄論文結(jié)果》窃肠，其中詳細(xì)較少了如何使用 TBtools 的系列插件包个，在本地筆記本電腦...
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老師，為什么我用Primer Check沒(méi)有顯示出膠圖的選項(xiàng)冤留？只是給出了一個(gè)Primer Check Result而已碧囊，這是什么原因啊纤怒？
「Primer Check」支持「多態(tài)性」引物篩選了~~
寫(xiě)在前面 至此糯而，「TBtools」中「分子輔助育種」相關(guān)的功能釋放 30% 了。第一階段結(jié)束泊窘。余下功能熄驼，預(yù)計(jì)等暑期慢慢釋放像寒。「功能開(kāi)發(fā)」的難度谜洽。作為階段結(jié)束推文萝映，相對(duì)簡(jiǎn)單吴叶，是...
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「Primer Check」支持「多態(tài)性」引物篩選了~~寫(xiě)在前面 至此阐虚，「TBtools」中「分子輔助育種」相關(guān)的功能釋放 30% 了。第一階段結(jié)束蚌卤。余下功能实束，預(yù)計(jì)等暑期慢慢釋放⊙放恚「功能開(kāi)發(fā)」的難度咸灿。作為階段結(jié)束推文，相對(duì)簡(jiǎn)單侮叮，是...
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植物研究常用的數(shù)據(jù)庫(kù)總結(jié)
1.基因組綜合研究數(shù)據(jù)庫(kù) 數(shù)據(jù)庫(kù)植物網(wǎng)址TAIR擬南芥http://www.arabidopsis.org/[http://www.arabidopsis.org/]SIGn...
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記錄NCBI下載基因組的大坑寫(xiě)在前面 最近分析的物種由于國(guó)外品種與國(guó)內(nèi)品種差異還是比較大避矢，雖然大部分文章用的參考基因組都是以國(guó)外品種為主，但是由于考慮到目前我這邊數(shù)據(jù)幾乎全部都是來(lái)源于國(guó)內(nèi)品種囊榜，因此在考...
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生物小工具本文主要介紹一些生物小工具,尤其是在文章中的审胸，還有就是生物信息學(xué)方面的，總而言之卸勺，言而總之砂沛，希望能夠幫助到大家。 關(guān)鍵詞：生物信息學(xué)工具;繪圖工具 1曙求、itol用于對(duì)系統(tǒng)進(jìn)化...
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Integrative Bioinformatics |「第二次」參與編寫(xiě)的「第一本」書(shū)籍出版了碍庵！寫(xiě)在前面 從某個(gè)角度上來(lái)說(shuō)，「TBtools」基本長(zhǎng)成一個(gè)相對(duì)常見(jiàn)的悟狱，偏向于大眾化的生物信息學(xué)小工具静浴。過(guò)去幾年的不間斷開(kāi)發(fā)，不僅僅得到用戶(hù)認(rèn)可挤渐，也得到了部分生信科研工作者的認(rèn)...
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TBtools | 在 Motifs 上標(biāo)記 Domains 的覆蓋狀況~寫(xiě)在前面 最近在做一些序列分析苹享，發(fā)現(xiàn)很久以前的一個(gè)看起來(lái)或許沒(méi)啥用的功能，其實(shí)還是有用挣菲。大體就是富稻，當(dāng)我們?cè)诜治瞿硞€(gè)家族成員的時(shí)候，我們或許想知道白胀，到底感興趣的分支椭赋，相對(duì)于其他...
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插件 | 上課神器 Simple Screen Draw盡管我工作就一年半，但其實(shí)我給人上課卻有七八年或杠。一直以來(lái)哪怔，我就想有一個(gè)功能，可以直接在當(dāng)前屏幕上“畫(huà)畫(huà)畫(huà)”。這樣會(huì)非常方便演示认境。找來(lái)找去胚委，發(fā)現(xiàn)一個(gè)叫 Pointofix 的似...
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呼朋喚友 | 「TBtools」使用問(wèn)題快速解決！寫(xiě)在前面 「TBtools」開(kāi)發(fā)至今也有 7 年叉信。七年之癢亩冬，說(shuō)實(shí)話(huà)，不是沒(méi)有硼身。但感情總是比矛盾更深厚硅急。雖然我現(xiàn)在已經(jīng)很少有時(shí)間精力去查看「TBtools」在線社群的問(wèn)題了，但...
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【動(dòng)植物研究動(dòng)態(tài)】20220529文獻(xiàn)解讀
Cell | 黃學(xué)輝/黃三文/韓斌/李家洋受邀發(fā)表作物馴化育種的遺傳學(xué)研究綜述[https://mp.weixin.qq.com/s/l2GEq3V9oUPhETPs7FnQ...
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您好佳遂！請(qǐng)問(wèn)有沒(méi)有比較好的分析軟件推薦营袜，全基因選擇育種是不是只能做重測(cè)序才能進(jìn)行后續(xù)分析，可不可以采用已有參考基因組的數(shù)據(jù)進(jìn)行丑罪？
全基因組選擇育種（GS）簡(jiǎn)介
全基因組選擇（Genomic selection, GS）是一種利用覆蓋全基因組的高密度標(biāo)記進(jìn)行選擇育種的新方法荚板，可通過(guò)早期選擇縮短世代間隔，提高育種值（Genomic Es...