最近在做一個分析的時候，需要使用到python，而我的單細胞數(shù)據(jù)是seurat對象姨伤，所以需要轉(zhuǎn)化一下碌更，變成h5ad稀拐。關(guān)于seurat轉(zhuǎn)h5ad的...

先來個簡單的赡鲜，之前有小伙伴咨詢一篇Cell文章中的餅圖吝镣，展示的是celltype比例睬塌，其實之前我們寫過很多展示細胞比例的圖泉蝌，這里復(fù)現(xiàn)這個3D版的...

看到了一篇Nature的UMAP圖，展示的是單細胞揩晴，但是特點是標記了celltype的同時指示了marker基因勋陪。顯然這個處理很有特色，我們可以...

和之前雙細胞去除一樣硫兰，诅愚，單細胞轉(zhuǎn)錄組分析去除環(huán)境污染RNA也是一個可選的內(nèi)容。為什么會出現(xiàn)這么一個問題呢劫映，還是受限于目前的單細胞技術(shù)而已违孝。通俗的...

起因是有小伙伴咨詢，做柱狀圖的時候泳赋，怎么添加趨勢線雌桑，其實很簡單，添加一個線性擬合圖層即可祖今。剛好最近看到這種圖校坑，在做分組表達量箱線圖或者小提琴圖的...

好看的圖千千萬，我就中意這一款千诬。關(guān)于作圖的注釋耍目，有很多種方法，有段時間徐绑，我很中意線條式的注釋邪驮。一般情況，用AI直接畫挺方便泵三，但是還是想使用代碼進...

近期在看文獻找圖的時候耕捞，看到一篇文章，一個詞走進我的眼簾烫幕，Ingenuity Pathway Analysis（IPA）俺抽，很熟悉，又很陌生较曼。熟悉...

之前微信群里小伙伴求助了一張圖磷斧，是一篇NC中關(guān)于cellchat結(jié)果的展示圖。特點是它的弦圖不像一般圖一樣只展示互作數(shù)目捷犹，而是展示細胞受配體弛饭。原...

接粉絲”舉報“，對于一篇Science文章中的圖表感興趣萍歉，在復(fù)現(xiàn)的過程中侣颂，我發(fā)現(xiàn)另外一張讓人感覺還可以的圖形，是關(guān)于富集結(jié)果的展示枪孩。富集分析真的...