對于基因的差異表達譜原朝，常用熱圖作為展示驯嘱。但有時差異基因可能非常的多，熱圖中不可能將所有基因的名稱標注出來喳坠。那么此時不妨選擇一些比較重要的基因（比方說p值最顯著的那些）鞠评，在圖中...
發(fā)簡信
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在熱圖中標注出特定基因的名稱 -
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RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差異基因分析→ggplot2作火山圖→biomaRt轉換ID并注釋請一定看這里：寫下來只是為了記錄一些自己的實踐剃幌，當然如果能對你有所幫助那就更好了，歡迎大家和我交流 差異分析流程: 1 初始數(shù)據(jù) 2 標準化(normalization)：D...
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生信技能樹新葉講師<br>這里是新葉的分身馬甲：信你個鬼<br>B站：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fspace.bilibili.com%2F2356770" target="_blank">https://space.bilibili.com/2356770</a><br>歡迎學習交流
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分享各種各樣的科研日常。
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2023-02-22 比較TCGA正常組織與腫瘤組織表達量（R包）今天發(fā)現(xiàn)了一個超有用的R包參考：比較TCGA正常組織與腫瘤組織表達量不能更方便 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/0e...
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target數(shù)據(jù)庫初探在簡書上看了很多文章，有很多收獲懒豹，但自己從來沒寫過芙盘。 生信有很久沒碰了，因為需要歼捐，又一次撿了起來何陆。 之前在TCGA數(shù)據(jù)庫一直沒有找到骨肉瘤的臨床數(shù)據(jù)，不能把基因表達和臨床預后...
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Q&A | 如何使用clusterProfiler對MSigDB數(shù)據(jù)庫進行富集分析Q&A | 如何使用clusterProfiler對MSigDB數(shù)據(jù)庫進行富集分析 [TOC] Question 有朋友在后臺提問：在使用clusterProfiler做富集...
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個人wx公眾號：木舟筆記。
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使用多組學生物信息學分析構建AML預后模型Construction of a solid Cox model for AML patients based on multiomics bioinformatic an...
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Nat Commun | 中國兒童AML基因突變譜研究揭示獨特的突變特征影響臨床風險分類在兒童腫瘤中，白血病是最常見的惡性腫瘤巩剖，其中15%~20%的兒童白血病屬于急性髓系白血猜燎睢（AML），且患者預后較差佳魔。目前曙聂，基于NGS技術的基因組圖譜已經(jīng)闡明了兒童AML的基因...
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公眾號: 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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聊UCSC xena的數(shù)據(jù)下載問題作者：白介素2 UCSC xena數(shù)據(jù)存儲中心總覽 UCSC xena的數(shù)據(jù) 存儲倉庫主要包括的數(shù)據(jù)有以下這些： TCGA hub Pan-Cancer Atlas Hub ...
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老師贤姆，我的第12行運行不出來榆苞，一直報錯“-f”
生信-使用R語言將gdc數(shù)據(jù)轉化為基因表達矩陣
從gdc-client下載數(shù)據(jù)后，接下來霞捡，我們可以嘗試把gdc數(shù)據(jù)轉化為基因表達矩陣坐漏，這里需要對原始數(shù)據(jù)文件進行加工處理 1.準備工作 創(chuàng)建一個工作目錄，將樣本文件夾放在al...
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生信-使用R語言將gdc數(shù)據(jù)轉化為基因表達矩陣從gdc-client下載數(shù)據(jù)后碧信，接下來赊琳，我們可以嘗試把gdc數(shù)據(jù)轉化為基因表達矩陣，這里需要對原始數(shù)據(jù)文件進行加工處理 1.準備工作 創(chuàng)建一個工作目錄砰碴，將樣本文件夾放在al...
