對(duì)于基因的差異表達(dá)譜，常用熱圖作為展示。但有時(shí)差異基因可能非常的多，熱圖中不可能將所有基因的名稱標(biāo)注出來(lái)馆类。那么此時(shí)不妨選擇一些比較重要的基因（比方說(shuō)p值最顯著的那些）搔体，在圖中...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：云南
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在熱圖中標(biāo)注出特定基因的名稱 -
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RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差異基因分析→ggplot2作火山圖→biomaRt轉(zhuǎn)換ID并注釋請(qǐng)一定看這里：寫下來(lái)只是為了記錄一些自己的實(shí)踐曹动，當(dāng)然如果能對(duì)你有所幫助那就更好了斋日，歡迎大家和我交流 差異分析流程: 1 初始數(shù)據(jù) 2 標(biāo)準(zhǔn)化(normalization)：D...
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生信技能樹新葉講師<br>這里是新葉的分身馬甲：信你個(gè)鬼<br>B站：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fspace.bilibili.com%2F2356770" target="_blank">https://space.bilibili.com/2356770</a><br>歡迎學(xué)習(xí)交流
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分享各種各樣的科研日常跛蛋。
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2023-02-22 比較TCGA正常組織與腫瘤組織表達(dá)量（R包）今天發(fā)現(xiàn)了一個(gè)超有用的R包參考：比較TCGA正常組織與腫瘤組織表達(dá)量不能更方便 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/0e...
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target數(shù)據(jù)庫(kù)初探在簡(jiǎn)書上看了很多文章橡伞，有很多收獲，但自己從來(lái)沒寫過(guò)晋被。 生信有很久沒碰了兑徘，因?yàn)樾枰忠淮螕炝似饋?lái)羡洛。 之前在TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)一直沒有找到骨肉瘤的臨床數(shù)據(jù)挂脑，不能把基因表達(dá)和臨床預(yù)后...
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Q&A | 如何使用clusterProfiler對(duì)MSigDB數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行富集分析Q&A | 如何使用clusterProfiler對(duì)MSigDB數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行富集分析 [TOC] Question 有朋友在后臺(tái)提問：在使用clusterProfiler做富集...
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個(gè)人wx公眾號(hào)：木舟筆記崭闲。
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使用多組學(xué)生物信息學(xué)分析構(gòu)建AML預(yù)后模型Construction of a solid Cox model for AML patients based on multiomics bioinformatic an...
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Nat Commun | 中國(guó)兒童AML基因突變譜研究揭示獨(dú)特的突變特征影響臨床風(fēng)險(xiǎn)分類在兒童腫瘤中都哭，白血病是最常見的惡性腫瘤肤无，其中15%~20%的兒童白血病屬于急性髓系白血病（AML）散劫，且患者預(yù)后較差韧涨。目前牍戚，基于NGS技術(shù)的基因組圖譜已經(jīng)闡明了兒童AML的基因...
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公眾號(hào): 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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聊UCSC xena的數(shù)據(jù)下載問題作者：白介素2 UCSC xena數(shù)據(jù)存儲(chǔ)中心總覽 UCSC xena的數(shù)據(jù) 存儲(chǔ)倉(cāng)庫(kù)主要包括的數(shù)據(jù)有以下這些： TCGA hub Pan-Cancer Atlas Hub ...
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老師舀奶，我的第12行運(yùn)行不出來(lái)暑竟，一直報(bào)錯(cuò)“-f”
生信-使用R語(yǔ)言將gdc數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為基因表達(dá)矩陣
從gdc-client下載數(shù)據(jù)后，接下來(lái)，我們可以嘗試把gdc數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為基因表達(dá)矩陣但荤，這里需要對(duì)原始數(shù)據(jù)文件進(jìn)行加工處理 1.準(zhǔn)備工作 創(chuàng)建一個(gè)工作目錄罗岖，將樣本文件夾放在al...
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生信-使用R語(yǔ)言將gdc數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為基因表達(dá)矩陣從gdc-client下載數(shù)據(jù)后，接下來(lái)腹躁，我們可以嘗試把gdc數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為基因表達(dá)矩陣桑包，這里需要對(duì)原始數(shù)據(jù)文件進(jìn)行加工處理 1.準(zhǔn)備工作 創(chuàng)建一個(gè)工作目錄，將樣本文件夾放在al...
