DNA甲基化是一種基本的表觀遺傳標記级乍，可以調(diào)控基因表達和染色質(zhì)組裝秉馏，從而為研究細胞身份和發(fā)育過程提供了重要視角豆茫。當前已有的數(shù)據(jù)集通常只包括部分甲基化位點，并且常澈耍基于在培養(yǎng)過...
發(fā)簡信
IP屬地：香港
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Nature：WGBS揭示最全正常人類細胞類型的綜合DNA甲基化圖譜 -
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生信分析：兩條件時間序列轉(zhuǎn)錄組的基因共表達網(wǎng)絡前一篇推送為大家解讀了2019年發(fā)表的PNAS文章，介紹了如何利用兩組時間序列轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)構建特定的基因共表達網(wǎng)絡以及利用這個網(wǎng)絡可以得到哪些信息。 這一期推送聚焦于具體的分析...
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可變剪切——可變剪接及其表觀遺傳調(diào)控
Original 表觀遺傳學習小組 Epigenetics表觀遺傳學 本文根據(jù) 2016 年 8 月復旦大學倪挺教授在「表觀基因組學暑期國際講習班」中的報告整理而成翅萤，本文采用...
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RNAseq轉(zhuǎn)錄組分析流程：fastp+hisat2+samtools+featureCounts+DESeq2
使用工具 fastp(質(zhì)控), hisat2(比對), samtools(sam文件轉(zhuǎn)bam文件), featureCounts(count計數(shù)), DESeq2(差異分析)...
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基因表達趨勢分析-2：Mfuzz基因表達趨勢分析-1：TCseq[http://www.reibang.com/p/b808085c7351] Mfuzz能夠識別表達譜的潛在時間序列模式，并將相似模式的基...
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1.CUT&Tag 數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（1）跟著官網(wǎng)[https://yezhengstat.github.io/CUTTag_tutorial/]學習CUT&Tag數(shù)據(jù)分析腊满，參考：protocol[https://w...
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GO-plot:超好看的GO富集可視化以下代碼均來自GO-plot的manual（GOplot (wencke.github.io)[https://wencke.github.io/]）套么。GO-plot用條形圖...
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DNA甲基化測序之TAPS日常掰蝦 ??前面分別學習了DNA甲基化的基礎知識和甲基化BS-seq的分析方法，不知道的同學可以戳這里碳蛋，DNA甲基化知識概述[https://mp.weixin.qq.co...
