我有兩個SNP的vcf文件坦刀,第一個文件是有
200個體,針對89條染色體做了個SNP篩選耻警,另外一個是100個體拘央,針對與上述相同基因組文件的前20條染色體做了一個SNP.vcf文件⊥科ǎ現(xiàn)在我想取他們兩個的SNP位點的合集,讓后做個曼哈頓圖灰伟,篩選出一定量的位點拆又。bcftools isce 能做個分析嗎
使用bcftools提取vcf文件中的特定信息可以使用工具 bcftools 中的 view 命令結合選項 -r 和 -s 來挑選特定的 SNP 位點。 選擇感興趣的樣本,使用 -s 選項帖族,比如選取樣本 A义矛、B、C: 選...