最近看了幾篇關(guān)于共線性分析的微信/簡書推送勒庄，發(fā)現(xiàn)不少研究人員把“編碼基因共線性”錯誤地描述為“全基因組共線性”鲤拿。這是兩個完全不同的概念罚屋，前者主要是基于蛋白水平，蛋白的保守性很...
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聊聊“基因組共線性” -
生物數(shù)據(jù)庫之二級蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫二級蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫數(shù)目眾多柏靶，我們挑幾個常用的給大家介紹冗美。 一兽赁、結(jié)構(gòu)域家族數(shù)據(jù)庫 Pfam Pfam 數(shù)據(jù)庫是一個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域家族的集合袁余，包括了一萬六千多個蛋白質(zhì)家族。蛋白質(zhì)一般...
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conda踩坑總結(jié)
深呼吸咱揍，捋一遍conda安裝軟件與環(huán)境管理 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/f62c8441b39b]另外這篇分享幫...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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這或許是我寫的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
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病毒是如何包裝成熟的煤裙？
80年代末掩完，美國《變形金剛》動畫片引入國內(nèi)，那時對霸天虎的金剛合體“大力神”喜愛無比硼砰。大力神由鏟土機且蓬、清掃機、推土機题翰、吊鉤恶阴、拖斗和攪拌機組裝而成，合體之時堅實有力豹障、節(jié)奏鏗鏘冯事、...
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病毒的毒力：被誤解的病毒學(xué)概念 II
我去年回校工作后，幾乎天天和研究生待在一起血公。我會發(fā)現(xiàn)他們科研方面的一些錯誤昵仅，作為科研工作者，我愿將我的所學(xué)與他們分享累魔，并糾正他們的錯誤摔笤。今天就涉及到他們嘴里經(jīng)常叨念的，但幾乎...
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病毒的結(jié)構(gòu)和非結(jié)構(gòu)蛋白：病毒學(xué)常見概念 III
2010年我碩士畢業(yè)答辯垦写，當(dāng)天的答辯主席是業(yè)界聲名顯赫的童光志教授÷朗溃現(xiàn)在回想，那天整體普遍答辯的一般梯澜，當(dāng)童教授向某同學(xué)提問關(guān)于豬瘟病毒結(jié)構(gòu)和非結(jié)構(gòu)蛋白的問題時寞冯，該同學(xué)竟然不知...
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病毒螺旋對稱結(jié)構(gòu)：病毒學(xué)常見概念I(lǐng)I
大學(xué)首門化學(xué)課是《普通化學(xué)》，應(yīng)用率雖不及后來的《生物化學(xué)》晚伙，但某些概念至今仍會幫助我去思考問題吮龄。雖已過去17年，但印象很深刻地是咆疗，理學(xué)院的張釩老師用不太標準的普通話給我們講...
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病毒學(xué)番外篇：反向遺傳的力量
如果選出病毒學(xué)領(lǐng)域最偉大的技術(shù)漓帚，反向遺傳學(xué)應(yīng)該當(dāng)之無愧！大多數(shù)病毒午磁，若想深入研究其機理尝抖，通痴泵牵回避不了反向遺傳。反向遺傳學(xué)這個概念實質(zhì)上是針對于傳統(tǒng)遺傳學(xué)而言的昧辽。用我博士舍友劉...
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病毒是如何進入細胞的衙熔？
病毒是嚴格胞內(nèi)“寄生”的微生物，當(dāng)脫離細胞后搅荞，病毒就會“本能”地去尋找下一個細胞宿主红氯，否則病毒就會死亡。一個孤零零的病毒咕痛，面前只有兩條路痢甘，或“拼命”尋找易感細胞，或面臨死亡茉贡。...
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病毒基因的復(fù)制塞栅、轉(zhuǎn)錄、翻譯（連載三腔丧，完結(jié)篇）
我關(guān)于病毒學(xué)的所有文章放椰，都是隨手寫寫，而非現(xiàn)學(xué)現(xiàn)賣愉粤，我只想驗證僅憑記憶能否將病毒學(xué)的主要框架勾勒出來庄敛。因為是隨手寫寫，所以無參考文獻科汗，請同行或研究生斧正藻烤。 今天是病毒復(fù)制、轉(zhuǎn)...
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病毒基因的復(fù)制头滔、轉(zhuǎn)錄怖亭、翻譯（連載二）
我讀博士一年級的時候，和劉文華老師同在紅島實驗室做課題坤检。關(guān)于一個轉(zhuǎn)錄的話題兴猩，至今令我難忘。人都是這樣早歇，當(dāng)受到別人知識恩惠的時候倾芝，總是難忘。 按照我在大學(xué)里學(xué)到的《生物化學(xué)》常...
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病毒基因的復(fù)制箭跳、轉(zhuǎn)錄晨另、翻譯（連載一）
給研一新生代課的時候，我盡量把病毒的分子生物學(xué)機制給學(xué)生多講一點谱姓，但并不能引起同學(xué)們的興趣借尿，少數(shù)研究生保持傲慢與不屑。我不斷給研一新生灌輸：孱弱的分子生物學(xué)底子必然限制你思考...
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病毒的形態(tài)是啥樣子？
作為一名普通的病毒學(xué)科研工作者路翻，我掌握的病毒學(xué)知識只不過是冰山一角狈癞。但我愿將冰山一角的病毒學(xué)知識與同行、與研究生茂契、與本科生分享蝶桶。今天和大家聊聊病毒的形態(tài)（morphology...
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為什么一定要學(xué)好“生物化學(xué)或分子生物學(xué)”（病毒學(xué)之話外篇）
小時候尝哆，父親給我講過一個故事《紀昌學(xué)射》秉撇。故事大意是，趙國有個年輕人秋泄，名叫紀昌琐馆，他夢想成為一名射箭高手，于是誠懇地去拜神射手飛衛(wèi)為師恒序。飛衛(wèi)說：“你先學(xué)會看東西不眨眼睛瘦麸，然后才...
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病毒正二十面體對稱結(jié)構(gòu)：病毒學(xué)常見概念 I
我對病毒學(xué)的喜愛滋饲，受先生影響。雖拜先生門下喊巍，但這些年與先生相處時間并不多屠缭。有時匆匆見一面，先生無意間提及的一個病毒學(xué)概念崭参，我都會花不少時間去查閱資料勿她，以加深印象。正如今天我要...
