最近看了幾篇關于共線性分析的微信/簡書推送灾梦，發(fā)現(xiàn)不少研究人員把“編碼基因共線性”錯誤地描述為“全基因組共線性”旧乞。這是兩個完全不同的概念，前者主要是基于蛋白水平甚纲，蛋白的保守性很...
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聊聊“基因組共線性” -
生物數(shù)據(jù)庫之二級蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫二級蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫數(shù)目眾多，我們挑幾個常用的給大家介紹喉镰。 一内贮、結構域家族數(shù)據(jù)庫 Pfam Pfam 數(shù)據(jù)庫是一個蛋白質(zhì)結構域家族的集合，包括了一萬六千多個蛋白質(zhì)家族讨永。蛋白質(zhì)一般...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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這或許是我寫的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
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病毒是如何包裝成熟的揭糕？
80年代末，美國《變形金剛》動畫片引入國內(nèi)锻霎，那時對霸天虎的金剛合體“大力神”喜愛無比著角。大力神由鏟土機、清掃機旋恼、推土機吏口、吊鉤、拖斗和攪拌機組裝而成，合體之時堅實有力产徊、節(jié)奏鏗鏘昂勒、...
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病毒的毒力：被誤解的病毒學概念 II
我去年回校工作后，幾乎天天和研究生待在一起舟铜。我會發(fā)現(xiàn)他們科研方面的一些錯誤戈盈，作為科研工作者，我愿將我的所學與他們分享谆刨，并糾正他們的錯誤塘娶。今天就涉及到他們嘴里經(jīng)常叨念的，但幾乎...
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病毒的結構和非結構蛋白：病毒學常見概念 III
2010年我碩士畢業(yè)答辯痴荐，當天的答辯主席是業(yè)界聲名顯赫的童光志教授⊙現(xiàn)在回想，那天整體普遍答辯的一般生兆，當童教授向某同學提問關于豬瘟病毒結構和非結構蛋白的問題時难捌，該同學竟然不知...
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病毒螺旋對稱結構：病毒學常見概念II
大學首門化學課是《普通化學》，應用率雖不及后來的《生物化學》鸦难，但某些概念至今仍會幫助我去思考問題根吁。雖已過去17年，但印象很深刻地是合蔽，理學院的張釩老師用不太標準的普通話給我們講...
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病毒學番外篇：反向遺傳的力量
如果選出病毒學領域最偉大的技術击敌，反向遺傳學應該當之無愧！大多數(shù)病毒拴事，若想深入研究其機理沃斤，通常回避不了反向遺傳刃宵。反向遺傳學這個概念實質(zhì)上是針對于傳統(tǒng)遺傳學而言的衡瓶。用我博士舍友劉...
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病毒是如何進入細胞的？
病毒是嚴格胞內(nèi)“寄生”的微生物牲证，當脫離細胞后哮针，病毒就會“本能”地去尋找下一個細胞宿主，否則病毒就會死亡坦袍。一個孤零零的病毒十厢，面前只有兩條路，或“拼命”尋找易感細胞捂齐，或面臨死亡蛮放。...
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病毒基因的復制、轉(zhuǎn)錄奠宜、翻譯（連載三包颁，完結篇）
我關于病毒學的所有文章缝其，都是隨手寫寫，而非現(xiàn)學現(xiàn)賣徘六，我只想驗證僅憑記憶能否將病毒學的主要框架勾勒出來。因為是隨手寫寫榴都，所以無參考文獻待锈，請同行或研究生斧正。 今天是病毒復制嘴高、轉(zhuǎn)...
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病毒基因的復制竿音、轉(zhuǎn)錄、翻譯（連載二）
我讀博士一年級的時候拴驮，和劉文華老師同在紅島實驗室做課題春瞬。關于一個轉(zhuǎn)錄的話題，至今令我難忘套啤。人都是這樣宽气，當受到別人知識恩惠的時候，總是難忘潜沦。 按照我在大學里學到的《生物化學》常...
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病毒基因的復制萄涯、轉(zhuǎn)錄、翻譯（連載一）
給研一新生代課的時候唆鸡，我盡量把病毒的分子生物學機制給學生多講一點帝牡，但并不能引起同學們的興趣赂苗，少數(shù)研究生保持傲慢與不屑。我不斷給研一新生灌輸：孱弱的分子生物學底子必然限制你思考...
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病毒的形態(tài)是啥樣子？
作為一名普通的病毒學科研工作者葱色，我掌握的病毒學知識只不過是冰山一角。但我愿將冰山一角的病毒學知識與同行匾南、與研究生囊骤、與本科生分享。今天和大家聊聊病毒的形態(tài)（morphology...
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病毒是如何分類的刻蟹？
我讀研究生的時候逗旁，我一大哥在中國海洋大學讀研究生，研究魚的分類學舆瘪。他說魚是脊椎動物片效，分類及其復雜，甚至可單獨劃分一門學科去加以研究英古。病毒是目前已知的最小生物淀衣，分類肯定不如高等...
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為什么一定要學好“生物化學或分子生物學”（病毒學之話外篇）
小時候，父親給我講過一個故事《紀昌學射》册舞。故事大意是蕴掏，趙國有個年輕人，名叫紀昌调鲸，他夢想成為一名射箭高手盛杰，于是誠懇地去拜神射手飛衛(wèi)為師。飛衛(wèi)說：“你先學會看東西不眨眼睛藐石，然后才...
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病毒正二十面體對稱結構：病毒學常見概念 I
我對病毒學的喜愛于微，受先生影響逗嫡。雖拜先生門下，但這些年與先生相處時間并不多角雷。有時匆匆見一面祸穷，先生無意間提及的一個病毒學概念，我都會花不少時間去查閱資料勺三，以加深印象雷滚。正如今天我要...
