文章壮虫，重在研究思路步藕。有好的思路，才能有精彩的故事科展。很多時(shí)候藻雌，我們想找一個(gè)好點(diǎn)子栅贴，比如性狀著瓶，疾病相關(guān)的關(guān)鍵分子，需要設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)瓣履，做大量的分子篩選的工作率翅，對(duì)于土豪實(shí)驗(yàn)室可以可以大把...
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TCGA和GEO套路文章解說 -
您好冕臭，歡迎訂閱“科研貓”！<br>致敬科研工作者燕锥，貓一樣的精靈們浴韭！<br>細(xì)致敏銳地“捕捉”科研思路；<br>“飛檐走壁”于各種崎嶇困境脯宿；<br>文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)大海里的“捕魚能手”；<br>實(shí)驗(yàn)室里孤獨(dú)的“夜行俠”和“潔癖精”泉粉；<br>本號(hào)连霉，旨在營造活躍的生物醫(yī)學(xué)科研交流平臺(tái)榴芳，歡迎您的加入。
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將ICGC的基因表達(dá)數(shù)據(jù)處理成表達(dá)矩陣（perl）小程序的目的 最近在搞ICGC的數(shù)據(jù)庫躏嚎，想作為TCGA數(shù)據(jù)挖掘的驗(yàn)證集，然后發(fā)現(xiàn)ICGC下下來的數(shù)據(jù)不能夠直接用于分析菩貌，于是寫個(gè)小的perl處理了一下卢佣，能夠分別輸出標(biāo)準(zhǔn)化過的...
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ICGC-DCC腫瘤數(shù)據(jù)庫初識(shí)一、概況 ICGC全稱是International Cancer Genome Consortium (國際癌癥基因組聯(lián)合體)箭阶。其旨在發(fā)起和協(xié)調(diào)大量的研究項(xiàng)目虚茶，其共同目標(biāo)是全...
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GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘生物信息文章解讀（宮頸癌） TCGA GEO
今天我們介紹一篇稍高分?jǐn)?shù)的文章，來看一下生信挖掘文章如何發(fā)更高檔次的雜志仇参。這篇文章是利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘?qū)m頸癌預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵基因嘹叫，2019年發(fā)表在Journal of...
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GEO罩扇、TCGA多數(shù)據(jù)庫聯(lián)合挖掘胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后關(guān)鍵基因胰腺導(dǎo)管腺癌的五年生存率低于5%，是目前主要致死的癌癥之一抓谴。如何結(jié)合多個(gè)公開數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)分析和挖掘此類癌癥臨床診斷和預(yù)后的關(guān)鍵基因呢暮蹂？這里就給大家介紹一篇文獻(xiàn)：基于共表達(dá)分析鑒...
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腫瘤突變分析神器-maftools包得益于曾老師的介紹引導(dǎo)，了解此包癌压。了解一個(gè)包仰泻，先看包的說明書，包的用法都在里面滩届。maftools包說明書 1.安裝包集侯，加載包 source("http://bioconduc...
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個(gè)性化生信分析
