文章侣签，重在研究思路藻治。有好的思路献起，才能有精彩的故事。很多時(shí)候抢野，我們想找一個(gè)好點(diǎn)子，比如性狀，疾病相關(guān)的關(guān)鍵分子脾还，需要設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)，做大量的分子篩選的工作入愧，對(duì)于土豪實(shí)驗(yàn)室可以可以大把...
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TCGA和GEO套路文章解說(shuō) -
您好棺蛛，歡迎訂閱“科研貓”怔蚌！<br>致敬科研工作者，貓一樣的精靈們旁赊！<br>細(xì)致敏銳地“捕捉”科研思路桦踊；<br>“飛檐走壁”于各種崎嶇困境；<br>文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)大海里的“捕魚(yú)能手”终畅；<br>實(shí)驗(yàn)室里孤獨(dú)的“夜行俠”和“潔癖精”籍胯；<br>本號(hào)，旨在營(yíng)造活躍的生物醫(yī)學(xué)科研交流平臺(tái)离福，歡迎您的加入杖狼。
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將ICGC的基因表達(dá)數(shù)據(jù)處理成表達(dá)矩陣（perl）小程序的目的 最近在搞ICGC的數(shù)據(jù)庫(kù)次舌，想作為T(mén)CGA數(shù)據(jù)挖掘的驗(yàn)證集斜友，然后發(fā)現(xiàn)ICGC下下來(lái)的數(shù)據(jù)不能夠直接用于分析，于是寫(xiě)個(gè)小的perl處理了一下垃它，能夠分別輸出標(biāo)準(zhǔn)化過(guò)的...
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ICGC-DCC腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)初識(shí)一鲜屏、概況 ICGC全稱(chēng)是International Cancer Genome Consortium (國(guó)際癌癥基因組聯(lián)合體)。其旨在發(fā)起和協(xié)調(diào)大量的研究項(xiàng)目国拇，其共同目標(biāo)是全...
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GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘生物信息文章解讀（宮頸癌） TCGA GEO
今天我們介紹一篇稍高分?jǐn)?shù)的文章洛史，來(lái)看一下生信挖掘文章如何發(fā)更高檔次的雜志。這篇文章是利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘?qū)m頸癌預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵基因酱吝，2019年發(fā)表在Journal of...
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GEO、TCGA多數(shù)據(jù)庫(kù)聯(lián)合挖掘胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后關(guān)鍵基因胰腺導(dǎo)管腺癌的五年生存率低于5%忆嗜，是目前主要致死的癌癥之一己儒。如何結(jié)合多個(gè)公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)分析和挖掘此類(lèi)癌癥臨床診斷和預(yù)后的關(guān)鍵基因呢？這里就給大家介紹一篇文獻(xiàn)：基于共表達(dá)分析鑒...
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腫瘤突變分析神器-maftools包得益于曾老師的介紹引導(dǎo)捆毫，了解此包闪湾。了解一個(gè)包，先看包的說(shuō)明書(shū)绩卤，包的用法都在里面途样。maftools包說(shuō)明書(shū) 1.安裝包，加載包 source("http://bioconduc...
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個(gè)性化生信分析
