1茅郎、群體結構及其對 GWAS 的影響 群體結構的來源image.png群體結構對GWAS的影響--混淆變量Ancestry可以導致混淆變量(confounding varia...
全基因組關聯(lián)分析是基于數(shù)量性狀連鎖不平衡理論碍侦,通過表型與基因型關聯(lián)分析獲得影響表型性狀的顯著關聯(lián)標記恨旱。 1. 軟件 Tassel / Gaipt / FarmCPU / mr...
最近在用Colony熟尉,和Cervus有所區(qū)別归露。下面是翻譯自Colony的用戶指南,供理解學習斤儿。軟件下載地址官方COLONY | Zoological Society of L...
最近需要幫FR做基于SSR標記的不同桃品種遺傳多樣性分析剧包,對從來沒有接觸過這類分析的本人來講恐锦,面對需要分析的數(shù)據(jù)一籌莫展,連看懂都覺得困難疆液。剛開始準備請教身邊的朋友一铅,但是大家...
拖拖拉拉用了一年時間才把GWAS整個流程捋完掉缺,從背景到code卜录、還有過程中遇到的一些bug以及解決辦法,加起來也有二十余篇眶明,按分析的流程整理出一份清單艰毒,也許以后有新的方法或者...
NOTE 基于種群聚類,特有等位基因 基本概念 1 多態(tài)性條帶 個人理解就是ssr引物1 在位點 擴增出的 a b 2個條帶(2倍體),ab長度可能相同也可能不相同搜囱。如果a條...