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全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）-群體結(jié)構(gòu)與親緣關(guān)系1、群體結(jié)構(gòu)及其對(duì) GWAS 的影響 群體結(jié)構(gòu)的來(lái)源image.png群體結(jié)構(gòu)對(duì)GWAS的影響--混淆變量Ancestry可以導(dǎo)致混淆變量（confounding varia...
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玉米全基因關(guān)聯(lián)分析 ( GWAS Analysis Pipeline )全基因組關(guān)聯(lián)分析是基于數(shù)量性狀連鎖不平衡理論米诉，通過(guò)表型與基因型關(guān)聯(lián)分析獲得影響表型性狀的顯著關(guān)聯(lián)標(biāo)記币狠。 1. 軟件 Tassel / Gaipt / FarmCPU / mr...
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系譜重建 colony 使用指南最近在用Colony游两，和Cervus有所區(qū)別。下面是翻譯自Colony的用戶指南漩绵，供理解學(xué)習(xí)贱案。軟件下載地址官方COLONY | Zoological Society of L...
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解鎖正確安裝POWERMARKER的姿勢(shì)最近需要幫FR做基于SSR標(biāo)記的不同桃品種遺傳多樣性分析，對(duì)從來(lái)沒有接觸過(guò)這類分析的本人來(lái)講止吐，面對(duì)需要分析的數(shù)據(jù)一籌莫展宝踪，連看懂都覺得困難。剛開始準(zhǔn)備請(qǐng)教身邊的朋友祟印，但是大家...
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析全流程
拖拖拉拉用了一年時(shí)間才把GWAS整個(gè)流程捋完肴沫，從背景到code粟害、還有過(guò)程中遇到的一些bug以及解決辦法蕴忆，加起來(lái)也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清單悲幅，也許以后有新的方法或者...
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基于的ssr 遺傳多樣性分析NOTE 基于種群聚類,特有等位基因 基本概念 1 多態(tài)性條帶 個(gè)人理解就是ssr引物1 在位點(diǎn) 擴(kuò)增出的 a b 2個(gè)條帶（2倍體）套鹅，ab長(zhǎng)度可能相同也可能不相同站蝠。如果a條...
