240 發(fā)簡(jiǎn)信
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  • 催更朽砰!????

    MySQL一些我不熟悉的技巧

    1. 插入數(shù)據(jù) 簡(jiǎn)單插入數(shù)據(jù) 批量插入數(shù)據(jù) insert ignore into table [(cols)] # 檢查數(shù)據(jù)尖滚,如果有重復(fù)的數(shù)據(jù)則忽略插入的數(shù)據(jù) replace...

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    【R去重】 保留第一個(gè)重復(fù)/去所有的重復(fù)

    參考: R語言第二章數(shù)據(jù)處理③刪除重復(fù)數(shù)據(jù)果子學(xué)生信 1.保留第一個(gè)重復(fù): A,A,B,C --->A,B,C2.去掉所有重復(fù):A,A,B,C --->B,C一般情況函數(shù)默認(rèn)...

  • vs code更改默認(rèn)終端 conda activate激活

    緣起:今天想嘗試在vs code中使用python,出現(xiàn)了幾行warning造锅,大意是conda無法激活置逻。 總結(jié)經(jīng)驗(yàn): Anaconda可以看作是一個(gè)虛擬機(jī),我們的python...

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    Rnbeads包差異甲基化分析

    愚人節(jié)快樂备绽。 導(dǎo)入數(shù)據(jù)券坞,設(shè)置選項(xiàng) hESCs vshiPSCs 注釋文件路徑 告訴軟件測(cè)序數(shù)據(jù)是哪個(gè)平臺(tái)的數(shù)據(jù) 測(cè)序數(shù)據(jù)路徑(450K:idat文件) 選擇option pr...

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    差異分析的檢驗(yàn)方法

    前言 眾所周知,當(dāng)你所自己今年比去年更優(yōu)秀的時(shí)候是不可以隨便吹牛的肺素,請(qǐng)把你在簡(jiǎn)書上發(fā)文的頻率以及質(zhì)量擺出來恨锚! 面對(duì)今年和去年的數(shù)據(jù),或許你需要一個(gè)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的方法... 組間差...

  • @Christophe_0c1f https://gtexportal.org/home/datasets@Christophe_0c1f https://gtexportal.org/home/datasets這個(gè)網(wǎng)址下有一個(gè)GTEx_Analysis_v8_Annotations_SampleAttributesDD.xlsx文件倍靡,可以下載來看一下

    復(fù)盤總結(jié)(三)

    GTEX表達(dá)矩陣預(yù)處理 R語言學(xué)習(xí):1.append添加新的列猴伶。2.R語言處理大規(guī)模數(shù)據(jù)速度不算快,通過安裝其他包比如data.table可以提升讀取處理速度。fread比r...

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    如何從UCSC上下載注釋文件以及gene_id相互對(duì)照文件

    下載注釋文件(以hg19為例) 下載gene_id相互對(duì)照文件 UCSC上的注釋文件還是非常全面的,clade選擇大的分支办桨,genome選擇物種筹淫,assembly選擇基因組對(duì)...

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    回家了,bug來了

    [lt@localhost ~]$ java -version Error: dl failure on line 597 Error: failed /data/home/...

  • 復(fù)盤總結(jié)(五)

    今天做展示PPT的時(shí)候發(fā)現(xiàn)可以用一種更簡(jiǎn)單的方式計(jì)算之前計(jì)算過的內(nèi)容呢撞,因此更新一下之前的結(jié)果损姜。1.相關(guān)性分析結(jié)果 2.組織特異性甲基化的啟動(dòng)子區(qū)域 得到2006個(gè)組織特異性甲...

  • 復(fù)盤總結(jié)(四)

    特異性分析 得到1495個(gè)組織特異性的啟動(dòng)子甲基化區(qū)域。(由12118個(gè)啟動(dòng)子甲基化區(qū)域得到)不重復(fù)的基因只有1392個(gè)殊霞,有一些基因在不只一個(gè)組織中摧阅,也有的基因在組織中重復(fù)出...

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    復(fù)盤總結(jié)(三)

    GTEX表達(dá)矩陣預(yù)處理 R語言學(xué)習(xí):1.append添加新的列。2.R語言處理大規(guī)模數(shù)據(jù)速度不算快绷蹲,通過安裝其他包比如data.table可以提升讀取處理速度棒卷。fread比r...

  • 復(fù)盤總結(jié)(二)

    接復(fù)盤總結(jié)(一) methylkit R包上游處理 對(duì)甲基化位點(diǎn)進(jìn)行注釋、導(dǎo)出SPM分析上游文件 幾點(diǎn)說明:1.啟動(dòng)子區(qū)域的選茸8帧:上下游250bp比规,參考文獻(xiàn)中做法。當(dāng)然也有選...

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    復(fù)盤總結(jié)(一)

    新年最適合干什么太颤?當(dāng)然是復(fù)盤總結(jié)0盹沈!先從代碼開始復(fù)盤龄章。 linux處理bed文件 用linux不多,還是一開始嘗試上游分析(測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)控乞封、比對(duì))的時(shí)候用的比較多做裙。linux...

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    盤一盤 生信技能樹R語言小作業(yè)(高級(jí))

    生信人的20個(gè)R語言習(xí)題 1.安裝一些R包: 2.了解ExpressionSet對(duì)象锚贱,比如CLL包里面就有data(sCLLex) ,找到它包含的元素关串,提取其表達(dá)矩陣(使用e...

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我是穿蓬蓬裙的小公舉拧廊。
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