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20天學(xué)會(huì)Python蠕嫁！Python編程基礎(chǔ)+Python編程高階+Python編程實(shí)戰(zhàn)（附贈(zèng)PDF）零基礎(chǔ)學(xué)編程，用Python入門是個(gè)不錯(cuò)的選擇多律，今天整理了Python從入門到精通的書籍 該文檔全面肛根、系統(tǒng)用爪、深入地講解了Python編程基礎(chǔ)語(yǔ)法與高級(jí)應(yīng)用粉渠。在講解過(guò)程中分冈，通過(guò)...
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shell腳本從入門到實(shí)戰(zhàn)
[TOC] Shell 是一個(gè)用 C 語(yǔ)言編寫的程序，它是用戶使用 Linux 的橋梁霸株。Shell 既是一種命令語(yǔ)言雕沉，又是一種程序設(shè)計(jì)語(yǔ)言。 Shell 環(huán)境Shell 編程...
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跟著Genes|Genomes|Genetics學(xué)數(shù)據(jù)分析：R語(yǔ)言edgeR包做轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)分析論文 Sex-Specific Co-expression Networks and Sex-Biased Gene Expression in the Salmonid B...
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<總結(jié)向> awk使用手冊(cè)
awk 用于文本文件的分析與處理 0x00 使用方法 awk '{pattern + action}' [filenames] 其中pattern代表的是正則表達(dá)式倔叼，用于匹配...
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甲基化倍性問(wèn)題新思路問(wèn)題的由來(lái) DNA methylation has diferent methylation patterns in alleles缀雳，對(duì)于等位基因來(lái)說(shuō)渡嚣，對(duì)于二倍體生物來(lái)說(shuō)梢睛，一...
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【免費(fèi)工具】3分鐘搞定GO/KEGG富集分析在進(jìn)行差異基因表達(dá)分析時(shí)肥印，得到顯著差異基因后，接下來(lái)就需要分析這些基因參與了哪些功能绝葡，常見(jiàn)的就是GO功能注釋和KEGG通路富集分析深碱，今天為大家介紹在線分析工具的使用——DAV...
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RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)（六）：GO、KEGG富集分析與enrichplot超全可視化攻略本節(jié)概覽：1.獲取DEG結(jié)果的上下調(diào)差異基因2.bitr()函數(shù)轉(zhuǎn)化基因名為entrez ID3.利用clusterProfiler進(jìn)行KEGG與GO富集4.用enrichp...
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GO、KEGG富集分析——DAVID與KOBAS在線分析工具在進(jìn)行差異基因表達(dá)分析時(shí)愉阎，得到顯著差異基因后绞蹦，接下來(lái)就需要分析這些基因參與了哪些功能，常見(jiàn)的就是GO功能注釋和KEGG通路富集分析榜旦，今天為大家介紹在線分析工具的使用——DAV...
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2022-03-13 GO和KEGG分析（一）---根據(jù)韋恩圖交集的基因進(jìn)行分析針對(duì)某個(gè)基因敲除的斑馬魚(yú)溅呢，在12-25天會(huì)逐漸死亡澡屡，因此我們選擇了8dpf 和16dpf 的由于進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，根據(jù)差異基因我們繪制了如下的韋恩圖咐旧，然后我們需要重點(diǎn)關(guān)注灰色區(qū)...
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R語(yǔ)言：clusterProfiler進(jìn)行GO富集分析和Gene_ID轉(zhuǎn)換
一驶鹉、讀取文件，ID轉(zhuǎn)換 1.讀取文件 2.ID轉(zhuǎn)換铣墨，ENTREZID是進(jìn)行GO分析最好的ID類型（針對(duì)clusterProfiler） ID轉(zhuǎn)換用到的是bitr()函數(shù)室埋，bi...
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RNA-seq(9):功能富集分析這部分開(kāi)始進(jìn)行基本的富集分析，兩類 A：差異基因富集分析（不需要表達(dá)值伊约，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不管有無(wú)差異词顾，需要全部genes...
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分析記錄 | 差異分析和KEGG GO物種Verticillium dahliae Kleb 1.deseq2差異分析 只有count數(shù)據(jù)。按照count數(shù)據(jù)建立col data表格碱妆。 因?yàn)閏ol data表格只...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
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2022-03-24利用BatMeth2分析甲基化數(shù)據(jù)
詳細(xì)參考路徑為：https://www.dna-asmdb.com/tools/batmeth2-tutorial/bt2-pipeline.html https://bat...
