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20天學(xué)會Python畏陕！Python編程基礎(chǔ)+Python編程高階+Python編程實戰(zhàn)（附贈PDF）零基礎(chǔ)學(xué)編程配乓，用Python入門是個不錯的選擇，今天整理了Python從入門到精通的書籍 該文檔全面惠毁、系統(tǒng)犹芹、深入地講解了Python編程基礎(chǔ)語法與高級應(yīng)用。在講解過程中仁讨，通過...
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shell腳本從入門到實戰(zhàn)
[TOC] Shell 是一個用 C 語言編寫的程序羽莺，它是用戶使用 Linux 的橋梁。Shell 既是一種命令語言洞豁，又是一種程序設(shè)計語言盐固。 Shell 環(huán)境Shell 編程...
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跟著Genes|Genomes|Genetics學(xué)數(shù)據(jù)分析：R語言edgeR包做轉(zhuǎn)錄組差異表達分析論文 Sex-Specific Co-expression Networks and Sex-Biased Gene Expression in the Salmonid B...
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<總結(jié)向> awk使用手冊
awk 用于文本文件的分析與處理 0x00 使用方法 awk '{pattern + action}' [filenames] 其中pattern代表的是正則表達式曙咽，用于匹配...
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甲基化倍性問題新思路問題的由來 DNA methylation has diferent methylation patterns in alleles例朱，對于等位基因來說孝情，對于二倍體生物來說鱼蝉，一...
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【免費工具】3分鐘搞定GO/KEGG富集分析在進行差異基因表達分析時，得到顯著差異基因后箫荡，接下來就需要分析這些基因參與了哪些功能魁亦，常見的就是GO功能注釋和KEGG通路富集分析，今天為大家介紹在線分析工具的使用——DAV...
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RNA-seq入門實戰(zhàn)（六）：GO羔挡、KEGG富集分析與enrichplot超全可視化攻略本節(jié)概覽：1.獲取DEG結(jié)果的上下調(diào)差異基因2.bitr()函數(shù)轉(zhuǎn)化基因名為entrez ID3.利用clusterProfiler進行KEGG與GO富集4.用enrichp...
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GO绞灼、KEGG富集分析——DAVID與KOBAS在線分析工具在進行差異基因表達分析時利术，得到顯著差異基因后，接下來就需要分析這些基因參與了哪些功能低矮，常見的就是GO功能注釋和KEGG通路富集分析印叁，今天為大家介紹在線分析工具的使用——DAV...
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2022-03-13 GO和KEGG分析（一）---根據(jù)韋恩圖交集的基因進行分析針對某個基因敲除的斑馬魚喉钢，在12-25天會逐漸死亡，因此我們選擇了8dpf 和16dpf 的由于進行轉(zhuǎn)錄組測序良姆，根據(jù)差異基因我們繪制了如下的韋恩圖肠虽，然后我們需要重點關(guān)注灰色區(qū)...
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R語言：clusterProfiler進行GO富集分析和Gene_ID轉(zhuǎn)換
一、讀取文件玛追，ID轉(zhuǎn)換 1.讀取文件 2.ID轉(zhuǎn)換税课，ENTREZID是進行GO分析最好的ID類型（針對clusterProfiler） ID轉(zhuǎn)換用到的是bitr()函數(shù)，bi...
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RNA-seq(9):功能富集分析這部分開始進行基本的富集分析痊剖，兩類 A：差異基因富集分析（不需要表達值韩玩，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不管有無差異，需要全部genes...
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分析記錄 | 差異分析和KEGG GO物種Verticillium dahliae Kleb 1.deseq2差異分析 只有count數(shù)據(jù)陆馁。按照count數(shù)據(jù)建立col data表格找颓。 因為col data表格只...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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2022-03-24利用BatMeth2分析甲基化數(shù)據(jù)
詳細(xì)參考路徑為：https://www.dna-asmdb.com/tools/batmeth2-tutorial/bt2-pipeline.html https://bat...
