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    (收藏貼)FastTree使用自我總結教程貼

    Step 1,使用序列比對工具進行序列比對,這里筆者用的mafft(官網(wǎng)說明:https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/) 官方:ma...

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    教你如何使用u盤安裝Linux系統(tǒng)

    小伙伴你們知道怎么使用u盤來安裝Linux系統(tǒng)嗎?可能大多數(shù)的人都好還不太清楚,不知道的也沒關系喲,小編這就來將u盤安裝Linux系統(tǒng)的操作步驟來帶給你們轧叽。 小伙伴之所以知道...

  • 二代測序質控

    測序數(shù)據(jù)質控統(tǒng)計--微不足道甥角?意義重大网严!轉https://genedock.com/article/2017/09/15/%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%95%B...

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    RNA-Seq數(shù)據(jù)分析—cutadapt質量控制

    可對fastq數(shù)據(jù)進行質量控制的軟件有很多,今天我們先學習cutadapt蜈膨。 安裝 官方幫助文檔 常用參數(shù) 我處理的數(shù)據(jù) 我的數(shù)據(jù)(GSE176393)是應用Illumina...

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    轉錄組數(shù)據(jù)分析——原始數(shù)據(jù)質量控制(QC)

    獲得轉錄組數(shù)據(jù)(.fastq文件)后的第一步就是對原始數(shù)據(jù)的質量控制翁巍。 目的 質量控制的目的是全面查看原始數(shù)據(jù)的質量驴一,內(nèi)容包括堿基質量評估、GC含量檢驗灶壶、N堿基數(shù)量評估肝断、TC...

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    2020-12-24 二代測序結果文件大小問題

    問題是,二代下機數(shù)據(jù)的Raw Reads乘以測序長度后為什么不等于Raw Base驰凛? Raw Reads簡稱為RR胸懈,Raw Base簡稱為RB。圖中RR是34040437個恰响,...

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    Fastq BAM VCF

    生信分析的旅程大致是,接收fastq,獲得bam枢劝,然后vcf FASTQ文件是什么?通常人們會拿著DNA的碎紙片,由碎紙片掃描的圖片文件,轉化成文本文件就是FASTQ 產(chǎn)生這...

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