RDX_74bf - 簡(jiǎn)書

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IP屬地：云南

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如果你是在GISTIC2的目錄下運(yùn)行就不會(huì)報(bào)這個(gè)錯(cuò)了，在其他路徑下運(yùn)行才會(huì)出現(xiàn)這種情況

GISTIC2.0安裝與使用（2019）
在一年前剛開始認(rèn)識(shí)GISTIC這個(gè)軟件的時(shí)候，我寫過一篇文檔記錄安裝過程。 Google搜索的第1個(gè)中文信息就是（2018年银酗，現(xiàn)在不是，文章現(xiàn)在已經(jīng)有過千次的引用啦~）。實(shí)...

王詩(shī)翔
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library(tibble)

TCGA學(xué)習(xí)03：生存分析
TCGA學(xué)習(xí)01：數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡(jiǎn)書 [http://www.reibang.com/p/79816a20cbb1]TCGA學(xué)習(xí)02：差異分析 - 簡(jiǎn)書 [htt...

小貝學(xué)生信
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生信start_site
寫了 343196 字窥浪，被 33407 人關(guān)注，獲得了 4150 個(gè)喜歡

MSKCC Research Associate 別趕不上野心笛丙，又辜負(fù)了努力
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柳葉刀與小鼠標(biāo)
寫了 0 字漾脂，被 6703 人關(guān)注，獲得了 4263 個(gè)喜歡

喜歡寫代碼的外科醫(yī)生胚鸯。
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Zotero
leoatchina 編骨稿，10 篇文章，147 人關(guān)注

Zotero 是一個(gè) Firefox 擴(kuò)展姜钳，用來收集坦冠，管理和引用你的研究資源。具體功能和特性列表如下：自動(dòng)捕獲引用（Automatically capture citations）遠(yuǎn)程備份和同步你的圖書館（Remotely back up and sync your library）存儲(chǔ) PDF 文檔哥桥、圖片和網(wǎng)頁(yè)（Store PDFs, images, and web pages）在Word和OpenOffice中交叉引用（ Cite from within Word and OpenOffice）支持任何語(yǔ)言的富文本筆記（Take rich-text notes in any language）[2.0版本引入的新特性] 廣泛的導(dǎo)入/導(dǎo)出選項(xiàng)（Wide variety of import/export options）免費(fèi)辙浑，開源和可擴(kuò)展（Free, open source, and extensible）群組圖書館協(xié)作（Collaborate with group libraries）按照集合和標(biāo)簽組織（Organize with collections and tags）從任何地方訪問你的圖書館（Access your library from anywhere）自動(dòng)從 PDF 中獲取元信息（Automatically grab metadata for PDFs）支持上萬(wàn)種參考文獻(xiàn)樣式（Use thousands of bibliographic styles）即時(shí)搜索 PDF 文檔和筆記（Instantly search your PDFs and notes）高級(jí)搜索和數(shù)據(jù)挖掘工具（Advanced search and data mining tools）多語(yǔ)言界面支持超過30種語(yǔ)言（Interface available in over 30 languages）推薦引擎和 RSS 訂閱（Recommendation engine and RSS feeds）
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寫了 0 字，被 1598 人關(guān)注拟糕，獲得了 3678 個(gè)喜歡
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寫了 0 字例衍，被 772 人關(guān)注，獲得了 861 個(gè)喜歡

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寫了 0 字已卸，被 1707 人關(guān)注佛玄，獲得了 872 個(gè)喜歡
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生存分析
憨憨記錄編，0 篇文章累澡，11 人關(guān)注

生存以及繪圖
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白菜代碼小推車
寫了 47956 字梦抢，被 432 人關(guān)注，獲得了 454 個(gè)喜歡

平常做點(diǎn) ?珍珠翡翠白玉湯? 你要是不介意的話也來一碗嘗嘗~ 裝逼的戴著R形狀的戒指?? 牽著??/?? 駱駝慢悠悠的逛街 后來碰到了一條蛇??纏著我不放 ??____???3??_???3???3______?? ??____ 那好吧愧哟，都一起來奥吩，跟著我種白菜吧！ ╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪ ╪ ?? ???? ?? ?? ?? ?? ?? | ╪ ?? ?? ?? ???? ?? ?? ?? | ╪ ?? ?? ?? ???? ?? ?? ?? | ╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪
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Perl 命令行實(shí)戰(zhàn)2 - fastq文件的相關(guān)操作
Perl 命令行實(shí)戰(zhàn)2 - fastq文件的相關(guān)操作注：部分代碼可能不太實(shí)用蕊梧，但是可以用來作為perl的單行程序的練習(xí)霞赫。本文會(huì)不斷更新... 目錄 fastq文件的介紹前...

白菜代碼小推車
5827 0 21
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生信分析流程
白菜代碼小推車編，194 篇文章肥矢，2706 人關(guān)注

收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章端衰。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程叠洗！如果簡(jiǎn)友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了旅东。望見諒灭抑！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看抵代。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq腾节、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python荤牍、perl案腺、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)的挖掘方法康吵，比如TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來的流程 ?? ?? ??

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TCGA腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)知識(shí)圖譜視頻課程學(xué)習(xí)筆記
因地制宜的生信達(dá)人編劈榨，9 篇文章，235 人關(guān)注

視頻在https://www.bilibili.com/video/av49363776 涎才，如果大家R語(yǔ)言能力不夠，就主要學(xué)習(xí)網(wǎng)頁(yè)工具 https://www.cbioportal.org/ 等等力九，如果R語(yǔ)言還行耍铜，就看代碼: https://github.com/jmzeng1314/tcga_example 如果確實(shí)有需要，還可以看看我們的付費(fèi)內(nèi)容：地址是 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/index.html
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GEO&TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘
765f2ea50d22 編跌前，-2 篇文章棕兼，114 人關(guān)注

生信小白也能玩轉(zhuǎn)GEO/TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)，關(guān)注微信公眾號(hào)：“百味科研芝士”抵乓，解鎖更多技能
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samtools伴挚，bedtools
1 samtools ? SAM全稱是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比對(duì)或聯(lián)配數(shù)據(jù)的格式。無論是重測(cè)序灾炭，還是轉(zhuǎn)錄組茎芋，還是表觀組，幾乎所有...

nnlrl
3445 0 14
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RNAseq分析流程：從測(cè)序Rawdata到Count輸出
在之前學(xué)習(xí)snakemake的基礎(chǔ)上蜈出，這里重新又對(duì)之前編寫的pipline進(jìn)行了優(yōu)化田弥，只需要在config.yaml中輸入相應(yīng)的samples，以及參考基因組路徑铡原，即可以得到...

dming1024
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11的霧
寫了 185719 字偷厦，被 693 人關(guān)注，獲得了 966 個(gè)喜歡

獨(dú)立開發(fā)者燕刻，終身學(xué)習(xí)者只泼，喜歡交朋友，歡迎討論卵洗，共同成長(zhǎng)请唱，一起進(jìn)步。