之前寫的的CHIP-seq和RNA-seq很多練習(xí)的數(shù)據(jù)都是從GEO數(shù)據(jù)庫下載的。但是從來沒有細(xì)致的了解過GEO這個數(shù)據(jù)庫。趁著還沒復(fù)工,再多學(xué)一點新知識~這次的筆記是生信技...
筆記回顧:1.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學(xué)習(xí)筆記(芯片數(shù)據(jù)下載和數(shù)據(jù)讀惹睢)2.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學(xué)習(xí)筆記(ID轉(zhuǎn)換)3.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學(xué)習(xí)筆記(了解你的表達(dá)矩陣) 這一講的視頻地址是:...
本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號议谷,轉(zhuǎn)載請注明出處 今天要給大家分享一個實用的差異分析工具——GEO2R炉爆。不需要語言基礎(chǔ),直接點點點就可以完成卧晓。 GEO2R是GEO數(shù)據(jù)庫中的一個在...
一逼裆、數(shù)據(jù)下載 官網(wǎng)——搜索并點擊GSE郁稍、GLP相應(yīng)文件下載 文件格式為: txt txt.gz(GSE文件) 二、對txt.gz文件進(jìn)行解壓縮 使用Rstudio 正常...
GEO2R(GEO to R)是GEO數(shù)據(jù)庫自帶的數(shù)據(jù)分析工具胜宇。GEO2R可以通過可視化的方式對基因表達(dá)譜進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析耀怜,在操作上非常方便恢着,但是,某些數(shù)據(jù)集不提供GEO2R功...
老大讓復(fù)現(xiàn)的是一張韋恩圖靡羡,來自3個數(shù)據(jù)集,分別找每個數(shù)據(jù)集的差異基因抖锥,然后取UP和DOWN的交集亿眠。原文鏈接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/...
基因表達(dá) 什么是基因表達(dá),如下是來自于維基百科的解釋: 研究方法 定量PCR 這部分我不太懂荆烈,所以就放幾段百度百科和維基百科的定義拯勉。 百度百科 定量PCR(即時聚合酶鏈鎖反應(yīng)...