生物信息學(xué)研究腔寡。
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GFF文件轉(zhuǎn)換Genbank文件及Mauve多序列比對(duì)前言 有很多軟件都可以完成gff文件到genbank文件的轉(zhuǎn)換旺拉，如腳本：https://github.com/chundruv/GFF-to-GenBank[https://...
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Mash: 使用MinHash快速估算基因距離
工具介紹 Mash擴(kuò)展了MinHash降維技術(shù)，使其成對(duì)的突變距離和P值顯著性檢驗(yàn)坪圾，從而可以有效地聚類和搜索大量序列集合垮衷。混搭將大序列和序列集還原為較小的代表性草圖又活，進(jìn)而可以...
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人間冬月有幸事柳骄，落葉與風(fēng)再相逢团赏。
人間冬月有幸事，落葉與風(fēng)再相逢耐薯。 來(lái)去都是自由風(fēng)舔清，相逢的人自會(huì)再相逢丝里。 生活就是離別和重逢不斷地交錯(cuò)出現(xiàn)，自由自在又必受世俗的約束体谒，相逢陪伴一程杯聚，離別各自一程，這就是我們的一...
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Fastq文件格式解析Fastq是測(cè)序數(shù)據(jù)下機(jī)格式抒痒，其中包含測(cè)序序列(reads)的序列信息及其對(duì)應(yīng)的測(cè)序質(zhì)量信息幌绍。FASTQ格式文件中每個(gè)read由四行描述，如下： 其中第一行以“@”開頭故响，隨后...
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本博客純屬胡說(shuō)八道彩届，有疑問(wèn)還請(qǐng)自行翻閱相關(guān)資料
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NCBI SRA數(shù)據(jù)庫(kù)使用詳解本文轉(zhuǎn)自生信人https://www.shengxin.ren/article/16 1伪冰、簡(jiǎn)介 SRA（Sequence ReadArchive）數(shù)據(jù)庫(kù)是用于存儲(chǔ)二代測(cè)序的原...
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神秘的細(xì)菌基因組：GC skew
科學(xué)就是整理事實(shí)，以便從中得出普遍的規(guī)律和結(jié)論樟蠕。from 達(dá)爾文 原文鏈接： 每當(dāng)我們拼接出一個(gè)完整的細(xì)菌基因組時(shí)糜值，總是迫不及待地畫出它的圖譜，一個(gè)常見的細(xì)菌基因組圖譜如下所...
