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clusterProfiler: 分析+可視化GO和KEGG富集的轉(zhuǎn)錄組R包寫作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計學分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
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債券風控實踐者橘茉，微信公眾號：riskcontroller
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請教潛哥這里只能使用ribo-seq測得的數(shù)據(jù)是么？
Ribo-seq分析必看文獻 | 知識（五）：RiboTaper之create_annotations_files.bash
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生信小技巧：實用的one-liners命令(1)
當你處理NGS文本信息時蛤克，相信你不多不少也有遇到過類似的煩惱捺癞，例如不知道如何只提取gene ID的名字，或者只提取gff file中某一列的某一行构挤，又或者想自己在每一行中添加...
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如何對基因組序列進行注釋基因組組裝完成后髓介，或者是完成了草圖，就不可避免遇到一個問題筋现，需要對基因組序列進行注釋唐础。注釋之前首先得構建基因模型，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
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Ribo-seq我的學習總貼
Ribo-seq分析綜述Ribo-seq分析Ribo-seq分析必看文獻 | 知識（一）：15年玉米Ribo-seq分析必看文獻 | 知識（二）：19年植物綜述之Polyso...
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seqkit的安裝與使用安裝： conda install seqkit ref:seqkit一個FASTA/Q序列處理神器 - 遺世獨立的愚公 - 博客園 一矾飞、序列操作： 1.取反向序列 seqk...
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啦啦啦洒沦，每天睡到自然醒吧
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多組學聯(lián)合分析-Matrix eQTL找到Matrix eQTL這個包豹绪，看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations（...
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Aspera數(shù)據(jù)下載快速應用本來下載數(shù)據(jù)用的是NCBI官方指定的sratool-kit里面帶的prefetch，本來實驗室網(wǎng)速快還沒啥問題申眼，但是這次碰到了一個硬茬瞒津，壓縮后數(shù)據(jù)15G，下載數(shù)次中斷括尸，后來轉(zhuǎn)...
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eQTL歸納幾篇eQTL相關文章巷蚪。 1.轉(zhuǎn)自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是數(shù)量性狀位點，比如身高是一個...
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VCF變異統(tǒng)計及繪制染色體分布圖VCF文件的變異分布圖濒翻，除了使用Circos圖之外屁柏，統(tǒng)計特定材料間的變異分布情況時可能會用到染色體分布圖，為了節(jié)省時間有送，實現(xiàn)統(tǒng)計及繪圖的自動化淌喻，現(xiàn)提供統(tǒng)計數(shù)量用的Python...
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請問哪個包？沒看到啊
扇⒕欤基圖怎么看怎么畫（附R代碼）
什么是伤凄停基圖 桑基圖（Sankey diagram）届宠，即伤嘎洌基能量分流圖，也叫赏阕ⅲ基能量平衡圖伤塌。它是一種特定類型的流程圖，圖中延伸的分支的寬度對應數(shù)據(jù)流量的大小轧铁，比較適用于用戶流...
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您好，能看看這個數(shù)據(jù)的EXCEL表格長那樣么~謝謝运沦！
杀枚睿基圖怎么看怎么畫（附R代碼）
什么是桑基圖 尚恚基圖（Sankey diagram）嫁盲，即桑基能量分流圖烈掠，也叫尚叱樱基能量平衡圖。它是一種特定類型的流程圖向叉，圖中延伸的分支的寬度對應數(shù)據(jù)流量的大小锥腻，比較適用于用戶流...
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RNA-seq(5):序列比對：Hisat2比對軟件很多，首先大家去收集一下母谎，因為我們是帶大家入門瘦黑，請統(tǒng)一用hisat2(官網(wǎng)https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
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kraken軟件操作手冊
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量分析完，想拿kraken軟件分析下數(shù)據(jù)有沒有微生物的序列污染 找了全網(wǎng)沒看見什么相關的指導文章奇唤，看官網(wǎng)的操作手冊也很雞助幸斥，所以自己翻譯了官網(wǎng)手冊以及寫了代碼，希...
