通過數(shù)據(jù)應(yīng)用技術(shù)分享劈愚，幫助用戶"用數(shù)據(jù)工具高效工作"杏愤。
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QQ：28720864
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clusterProfiler: 分析+可視化GO和KEGG富集的轉(zhuǎn)錄組R包寫作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
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債券風(fēng)控實(shí)踐者，微信公眾號：riskcontroller
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請教潛哥這里只能使用ribo-seq測得的數(shù)據(jù)是么渤刃？
Ribo-seq分析必看文獻(xiàn) | 知識（五）：RiboTaper之create_annotations_files.bash
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生信小技巧：實(shí)用的one-liners命令(1)
當(dāng)你處理NGS文本信息時(shí)拥峦，相信你不多不少也有遇到過類似的煩惱，例如不知道如何只提取gene ID的名字卖子，或者只提取gff file中某一列的某一行略号，又或者想自己在每一行中添加...
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如何對基因組序列進(jìn)行注釋基因組組裝完成后，或者是完成了草圖洋闽，就不可避免遇到一個(gè)問題玄柠，需要對基因組序列進(jìn)行注釋。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型诫舅，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
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Ribo-seq我的學(xué)習(xí)總貼
Ribo-seq分析綜述Ribo-seq分析Ribo-seq分析必看文獻(xiàn) | 知識（一）：15年玉米Ribo-seq分析必看文獻(xiàn) | 知識（二）：19年植物綜述之Polyso...
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seqkit的安裝與使用安裝： conda install seqkit ref:seqkit一個(gè)FASTA/Q序列處理神器 - 遺世獨(dú)立的愚公 - 博客園 一随闪、序列操作： 1.取反向序列 seqk...
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啦啦啦，每天睡到自然醒吧
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多組學(xué)聯(lián)合分析-Matrix eQTL找到Matrix eQTL這個(gè)包撮奏，看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations（...
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Aspera數(shù)據(jù)下載快速應(yīng)用本來下載數(shù)據(jù)用的是NCBI官方指定的sratool-kit里面帶的prefetch俏讹，本來實(shí)驗(yàn)室網(wǎng)速快還沒啥問題，但是這次碰到了一個(gè)硬茬畜吊，壓縮后數(shù)據(jù)15G泽疆，下載數(shù)次中斷，后來轉(zhuǎn)...
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eQTL歸納幾篇eQTL相關(guān)文章玲献。 1.轉(zhuǎn)自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是數(shù)量性狀位點(diǎn)殉疼，比如身高是一個(gè)...
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VCF變異統(tǒng)計(jì)及繪制染色體分布圖VCF文件的變異分布圖梯浪，除了使用Circos圖之外，統(tǒng)計(jì)特定材料間的變異分布情況時(shí)可能會用到染色體分布圖瓢娜，為了節(jié)省時(shí)間挂洛，實(shí)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)及繪圖的自動化，現(xiàn)提供統(tǒng)計(jì)數(shù)量用的Python...
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請問哪個(gè)包眠砾？沒看到啊
陕簿ⅲ基圖怎么看怎么畫（附R代碼）
什么是桑基圖 砂保基圖（Sankey diagram）柒巫，即桑基能量分流圖谷丸，也叫杀ぬ停基能量平衡圖。它是一種特定類型的流程圖刨疼，圖中延伸的分支的寬度對應(yīng)數(shù)據(jù)流量的大小泉唁，比較適用于用戶流...
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桑基圖怎么看怎么畫（附R代碼）什么是杀液荩基圖 捎瘟剑基圖（Sankey diagram），即射雒啵基能量分流圖贱案，也叫桑基能量平衡圖止吐。它是一種特定類型的流程圖宝踪，圖中延伸的分支的寬度對應(yīng)數(shù)據(jù)流量的大小，比較適用于用戶流...
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您好碍扔，能看看這個(gè)數(shù)據(jù)的EXCEL表格長那樣么~謝謝瘩燥！
桑基圖怎么看怎么畫（附R代碼）
什么是刹煌基圖 衫靼颍基圖（Sankey diagram），即啥眨基能量分流圖服鹅，也叫桑基能量平衡圖百新。它是一種特定類型的流程圖企软，圖中延伸的分支的寬度對應(yīng)數(shù)據(jù)流量的大小，比較適用于用戶流...
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RNA-seq(5):序列比對：Hisat2比對軟件很多饭望，首先大家去收集一下仗哨，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T形庭，請統(tǒng)一用hisat2(官網(wǎng)https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
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kraken軟件操作手冊
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量分析完，想拿kraken軟件分析下數(shù)據(jù)有沒有微生物的序列污染 找了全網(wǎng)沒看見什么相關(guān)的指導(dǎo)文章厌漂，看官網(wǎng)的操作手冊也很雞助萨醒，所以自己翻譯了官網(wǎng)手冊以及寫了代碼，希...
