文本處理是完成生信項目的基本功，能實現(xiàn)的方法絕對不止一種担汤，最先想到的肯定是你比較熟悉的媳搪，這個時候誰能抵過單行命令的誘惑呢？awk是由Alfred Aho瞧毙、Peter Wein...
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【linux】單行命令-第1部分：awk基礎(chǔ)
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RNA-seq用hisat2宙彪、stringtie撑柔、DESeq2分析一、安裝軟件 1您访、HISAT2 將reads比對到基因組上 2铅忿、StringTie 將比對好的reads進(jìn)行拼裝并預(yù)計表達(dá)水平 3、SAM tools 課上已經(jīng)用sudo a...
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fasta/fq文件處理萬能工具——Seqkit學(xué)習(xí)記錄
shenwei爪哥開發(fā)的處理Fasta/Fastq文件的萬能工具峻凫。之前處理fq/fa文件時花時間寫的一些腳本發(fā)現(xiàn)在seqkit里直接能一行命令就解決。實在是提升效率览露，整合流程...
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fastq 文件處理
2021/03/22 這是一個小任務(wù) 讀取某個目錄下的文件 結(jié)果是一個列表荧琼，包括此目錄下所有的文件的全稱 及 文件擴展名（.txt,.fasta,.gz等） 循環(huán)輸出每一個文...
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好記性不如爛筆頭命锄，溫故而知新堰乔。踏實一些，不要著急脐恩，你想要的歲月都會給你镐侯！
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淺淺的學(xué)習(xí)歷程<br>生信新手苟翻，打工人，搬運工骗污。<br>像王子文一樣財務(wù)自由崇猫，才可實現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致，才可實現(xiàn)職業(yè)自由
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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scRNAseq雙細(xì)胞去除-1: DoubletFinder10x平臺的雙細(xì)胞率（符合泊松分布1）： 根據(jù)Poisson分布，單個液滴包含超過一個細(xì)胞（doublets或multiplets）的頻率隨著上機細(xì)胞的濃度而改變贴谎。通常如果上...
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記錄自己學(xué)習(xí)python的點點滴滴軌跡擅这，希望以后回來看這個專題的時候澈魄，自己能有了更大的進(jìn)步ヾ(●′?｀●)?哇～
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讀《Single Cell Biomedicine》|| 新工具新視角前兩天朋友圈在傳一本Xiangdong Wang老師的一本書：Single-cell Sequencingand Methylation ：Methods and Clin...
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專注生信基礎(chǔ)知識结笨，包括測序原理，測序名詞解釋及各種概念湿镀！
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一起學(xué)生信。
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生物信息胸嘴；python/R/Shell編程學(xué)習(xí)~<br>生信博士在讀~ wx同號～
