測序上游分析系列: mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline:從raw r...
mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系統(tǒng)的terminal殴瘦! 盡管TCGA數(shù)據(jù)庫中已經(jīng)提供了大量的處理好的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù)狠角,但是無論是自身實驗需要,還是從NCBI的GEO...
簡書:沒有生物學(xué)重復(fù)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)怎么進(jìn)行差異分析姨蟋? edgeR需要的數(shù)據(jù)是reads數(shù),可以設(shè)置BCV值立帖,做單樣本的差異分析眼溶。edgeR包可以做無重復(fù)的差異分析,不過需要認(rèn)為...